More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1471 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  100 
 
 		 323 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  96.89 
 
 		 333 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 323 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  31.07 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  27.43 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  30.62 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  31.16 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  32.04 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  21.4 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  29.92 
 
 		 574 aa  72.8  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 		 358 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  32.77 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.49 
 
 		 672 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  36.89 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  29.89 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  31.49 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.76 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.9 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  32.32 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  28.96 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  36.28 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  30.64 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 1177 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  27.72 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.32 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  33.9 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  29.9 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 1177 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  20.92 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 572 aa  59.3  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  27.07 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  26.34 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1206  methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  27.07 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2204  methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  31.71 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  25.29 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  22.22 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  31.53 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 1314 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.05 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  31.21 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  26.14 
 
 		 401 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  38 
 
 		 1162 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  38 
 
 		 1523 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 244 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  31.53 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  25 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  31.36 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.16 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  28.9 
 
 		 607 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 		 1523 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.32 
 
 		 236 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  26.45 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 1312 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  30.09 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 194 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3431  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 1287 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 248 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 543 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  25.98 
 
 		 222 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  30.63 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2221  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>