More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1459 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  97.62 
 
 		 336 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  100 
 
 		 336 aa  662    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 336 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  85.71 
 
 		 336 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  85.42 
 
 		 336 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  86.9 
 
 		 334 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.21 
 
 		 333 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  72.17 
 
 		 333 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  69.88 
 
 		 334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  70.61 
 
 		 332 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  70.61 
 
 		 332 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  69.46 
 
 		 334 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.67 
 
 		 334 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  71.08 
 
 		 333 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  68.17 
 
 		 346 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  68.15 
 
 		 337 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  68.18 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  67.39 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  67.39 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  67.08 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  68.11 
 
 		 340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  68.09 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.84 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  66.27 
 
 		 349 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.23 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  65.92 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.1 
 
 		 350 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  62.79 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  62.89 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  63.35 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  62.85 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  63.69 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  63.69 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  63.81 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  62.23 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  59.64 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  64.22 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.09 
 
 		 308 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 		 320 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  50.16 
 
 		 321 aa  311  7.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  48.85 
 
 		 317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  47.71 
 
 		 317 aa  309  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.88 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.58 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.63 
 
 		 379 aa  298  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  48.32 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.44 
 
 		 351 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.03 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  49.22 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  48.71 
 
 		 356 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.22 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.22 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.97 
 
 		 334 aa  288  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.01 
 
 		 349 aa  285  9e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.04 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.76 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.39 
 
 		 338 aa  281  9e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  47.25 
 
 		 324 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  47.33 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.48 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.37 
 
 		 313 aa  268  7e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.46 
 
 		 341 aa  268  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.95 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  46 
 
 		 334 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  43.67 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.78 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  43.77 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.67 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  44.44 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  44.04 
 
 		 324 aa  249  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  42.3 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  45.66 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  40.74 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.37 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.69 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  41.82 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.99 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  46.88 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  46.88 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.82 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  42.54 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  42.81 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  41.37 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.85 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  45.25 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  44.62 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  43.69 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  38.98 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  44.94 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  41.56 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.81 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  39.87 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  40 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.57 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  43.75 
 
 		 370 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.3 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.03 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  44.09 
 
 		 345 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>