224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1378 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  737    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  95.8 
 
 		 357 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  85.99 
 
 		 357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  61.26 
 
 		 318 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  61.16 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  59.52 
 
 		 323 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  63.45 
 
 		 319 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  44.44 
 
 		 321 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  43.79 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  39.75 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  39.43 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  43.52 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  39.09 
 
 		 342 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  35.35 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  35.76 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  58.74 
 
 		 181 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  61.24 
 
 		 174 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  62.02 
 
 		 174 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  50.32 
 
 		 174 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  50.32 
 
 		 185 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  48.08 
 
 		 173 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  49.66 
 
 		 176 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  49.65 
 
 		 175 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  46.67 
 
 		 178 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  51.47 
 
 		 178 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  29.77 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  47.89 
 
 		 179 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  37.35 
 
 		 184 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  36.81 
 
 		 175 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  50.39 
 
 		 172 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  51.49 
 
 		 165 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  39.86 
 
 		 176 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  51.26 
 
 		 156 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  39.47 
 
 		 176 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  38.36 
 
 		 176 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  42.86 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  37.75 
 
 		 180 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  44.76 
 
 		 167 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  37.42 
 
 		 196 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  47.46 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  40.76 
 
 		 170 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  45.97 
 
 		 199 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  35.95 
 
 		 177 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  35.76 
 
 		 176 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  47.62 
 
 		 171 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  99  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  48.08 
 
 		 203 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  47.12 
 
 		 204 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  41.27 
 
 		 158 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  42.62 
 
 		 150 aa  96.3  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  41.98 
 
 		 157 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  35.54 
 
 		 184 aa  92.8  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  43.22 
 
 		 160 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  39.01 
 
 		 158 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  41.94 
 
 		 161 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  38.96 
 
 		 182 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  37.84 
 
 		 158 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  39.23 
 
 		 157 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  41.32 
 
 		 191 aa  89.4  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  39.22 
 
 		 158 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  41.13 
 
 		 154 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  37.4 
 
 		 167 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  40.43 
 
 		 156 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  40.43 
 
 		 156 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  35.48 
 
 		 162 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  35.61 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  36.13 
 
 		 138 aa  84  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  38.02 
 
 		 168 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  38.6 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  39.05 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  38.4 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  29.68 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  41.9 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  40.34 
 
 		 185 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  37.82 
 
 		 170 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  35.14 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  43.56 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  40.19 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4422  hypothetical protein  37.72 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  35.92 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  35.56 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  39.02 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  34.17 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  33.75 
 
 		 159 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  38.79 
 
 		 195 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  32.41 
 
 		 180 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  34.03 
 
 		 155 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  41.12 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  38.28 
 
 		 142 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  38.18 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>