43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1336 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  810    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  93.38 
 
 		 408 aa  718    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  98.04 
 
 		 408 aa  793    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  80.99 
 
 		 411 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  73.42 
 
 		 402 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  47.96 
 
 		 420 aa  322  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  47.4 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  47.66 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  47.66 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  49 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  46.83 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  46.99 
 
 		 386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  48.57 
 
 		 423 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  45.56 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  42.41 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  46.41 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  46.41 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  45.65 
 
 		 392 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  40.29 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  41.74 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  41.33 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  41.25 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  39.69 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  41.14 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  41.74 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  39.19 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  34.18 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  36.27 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  39.09 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  36.03 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  37.86 
 
 		 406 aa  200  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  38.17 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  41.61 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  44.4 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  40.91 
 
 		 391 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  22.8 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  23.8 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  21.73 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  21.07 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  22.52 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>