More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1218 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1158  transcriptional regulator, GntR family  96.48 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  78.32 
 
 		 230 aa  362  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  73.01 
 
 		 230 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1233  transcriptional regulator, GntR family  72.89 
 
 		 230 aa  335  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  59.64 
 
 		 230 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  56.44 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  52.65 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3115  GntR family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1855  GntR family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 231 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  52.3 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2028  GntR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3426  GntR family transcriptional regulator  52 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.100034 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5951  GntR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0388156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1523  GntR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 226 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 222 aa  98.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 222 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 214 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 231 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.42 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 235 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.91 
 
 		 215 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 232 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 216 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 290 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 232 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>