21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1205 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1365  OsmC family protein  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1205  OsmC family protein  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274132  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1144  OsmC family protein  95.24 
 
 		 147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2284  OsmC family protein  63.95 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3777  OsmC family protein  60.96 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3747  OsmC family protein  53.38 
 
 		 148 aa  156  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49110  redox protein  46.31 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2833  OsmC family protein  42.25 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  hitchhiker  0.00176763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2200  OsmC family protein  46.26 
 
 		 161 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0042  OsmC family protein  44.35 
 
 		 162 aa  103  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4182  OsmC family protein  36.49 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1521  hypothetical protein  36.91 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.483941  normal  0.516484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.92 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  25.74 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1812  OsmC family protein  23.85 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.251866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1777  OsmC family protein  23.85 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0283625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  28.8 
 
 		 146 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  43.48 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  29.92 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1286  OsmC/Ohr family protein  23.85 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0257508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  26.87 
 
 		 144 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>