68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1179 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  59.07 
 
 		 308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  59.4 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  64.08 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  66.34 
 
 		 641 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  61.95 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  41.8 
 
 		 469 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  43.16 
 
 		 447 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  42.37 
 
 		 465 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  49.73 
 
 		 493 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  45.21 
 
 		 465 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  41.58 
 
 		 1050 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  41.88 
 
 		 499 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  47.49 
 
 		 848 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  41.49 
 
 		 743 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  52.32 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  45.25 
 
 		 516 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  47.5 
 
 		 452 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  40.43 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  37.04 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  45.83 
 
 		 283 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  41.36 
 
 		 738 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  40.86 
 
 		 594 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1503 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  38.96 
 
 		 792 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  39.16 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  40.43 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  39.73 
 
 		 207 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  39.73 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  40.56 
 
 		 266 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  40.56 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  42.95 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40.69 
 
 		 561 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  37.93 
 
 		 833 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  38.03 
 
 		 220 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  39.31 
 
 		 232 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  42 
 
 		 425 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  32.29 
 
 		 212 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 		 589 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  34.08 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  33.12 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  40.54 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  28.83 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  36.49 
 
 		 767 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35 
 
 		 950 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  37.32 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  35.37 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  34.71 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  33.11 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  29.44 
 
 		 1462 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  31.13 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  32.48 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  33.12 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  39.16 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  35.66 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  34.78 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  29.83 
 
 		 1043 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  37.06 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  34.97 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  31.07 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  30.3 
 
 		 854 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2477  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  27.93 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1159  hypothetical protein  29.52 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  36.47 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  30.37 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>