More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1154 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  71.85 
 
 
240 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.39 
 
 
242 aa  276  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  55.31 
 
 
232 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  55.31 
 
 
232 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  55.31 
 
 
242 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  55.61 
 
 
242 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  54.87 
 
 
232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  55.61 
 
 
691 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  51.77 
 
 
228 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  54.87 
 
 
242 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  56.13 
 
 
238 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  54.34 
 
 
224 aa  214  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  53.42 
 
 
226 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.13 
 
 
224 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.87 
 
 
227 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  51.87 
 
 
227 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.87 
 
 
227 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  50.45 
 
 
234 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  47.19 
 
 
233 aa  201  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  50.22 
 
 
233 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  50.68 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.38 
 
 
225 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  48 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  49.77 
 
 
220 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.73 
 
 
225 aa  192  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.09 
 
 
227 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.63 
 
 
227 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  39.37 
 
 
228 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  39.37 
 
 
228 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  43.95 
 
 
232 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.77 
 
 
227 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  52.26 
 
 
228 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  52.26 
 
 
228 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  48 
 
 
242 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  52.41 
 
 
229 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  45.16 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  45.16 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.91 
 
 
231 aa  171  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  47 
 
 
238 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.44 
 
 
231 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  46.83 
 
 
212 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  44.1 
 
 
239 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.41 
 
 
230 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.53 
 
 
232 aa  164  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  50.7 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 
285 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  46.77 
 
 
261 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.13 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  47.4 
 
 
232 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  36.32 
 
 
231 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  45.77 
 
 
232 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  43.88 
 
 
241 aa  151  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.84 
 
 
246 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  42.99 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.07 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.16 
 
 
249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 
245 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  42.86 
 
 
245 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 
245 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.58 
 
 
239 aa  143  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.58 
 
 
234 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  39.24 
 
 
279 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.58 
 
 
234 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  43.39 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.36 
 
 
284 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.56 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.93 
 
 
284 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  48.26 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  38.1 
 
 
326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  37.33 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  47.06 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  45.23 
 
 
222 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  37.31 
 
 
297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.13 
 
 
284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.13 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.79 
 
 
251 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  43.52 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  47.65 
 
 
201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.76 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  40.38 
 
 
209 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  39.9 
 
 
218 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.78 
 
 
228 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.07 
 
 
210 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  33.5 
 
 
202 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.6 
 
 
231 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.73 
 
 
226 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  38.76 
 
 
233 aa  121  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  38.97 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  38.3 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  39.79 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  42.71 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.59 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  42.94 
 
 
187 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>