21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1112 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1112  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1255  hypothetical protein  97.33 
 
 		 187 aa  337  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6213  hypothetical protein  78.57 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.357243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4719  hypothetical protein  57.83 
 
 		 138 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0835  hypothetical protein  52.33 
 
 		 146 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.165946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4205  hypothetical protein  60.32 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0867  hypothetical protein  49.41 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.33158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0906  hypothetical protein  49.41 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00446262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3545  hypothetical protein  43.68 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1068  hypothetical protein  47.5 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5264  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160969  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6281  hypothetical protein  50.75 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1361  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185984  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5242  hypothetical protein  45.78 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0925743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1289  hypothetical protein  51.72 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0047  hypothetical protein  51.72 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3303  hypothetical protein  50.79 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3865  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0308026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1574  hypothetical protein  49.21 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3483  hypothetical protein  39.74 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3791  hypothetical protein  38.37 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>