More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1077 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 		 162 aa  337  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 		 162 aa  337  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  98.15 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  95.68 
 
 		 162 aa  326  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  95.68 
 
 		 162 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  94.44 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  87.65 
 
 		 162 aa  299  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  85.62 
 
 		 163 aa  293  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  83.95 
 
 		 162 aa  289  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  82.72 
 
 		 162 aa  288  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  83.75 
 
 		 163 aa  287  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  83.33 
 
 		 162 aa  287  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  83.85 
 
 		 163 aa  286  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  83.33 
 
 		 162 aa  286  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  83.85 
 
 		 163 aa  286  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  83.23 
 
 		 163 aa  286  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  82.72 
 
 		 162 aa  285  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  82.72 
 
 		 162 aa  286  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  82.1 
 
 		 162 aa  285  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  85.44 
 
 		 163 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  82.72 
 
 		 162 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  83.75 
 
 		 163 aa  283  9e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  81.99 
 
 		 163 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  80.86 
 
 		 162 aa  282  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  82.5 
 
 		 163 aa  275  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  84.67 
 
 		 163 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  75.93 
 
 		 161 aa  260  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  77.02 
 
 		 162 aa  260  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  75.93 
 
 		 164 aa  259  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  77.22 
 
 		 167 aa  258  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  76.58 
 
 		 167 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  76.58 
 
 		 167 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  73.29 
 
 		 163 aa  255  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  76.58 
 
 		 164 aa  254  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  76.58 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  74.05 
 
 		 163 aa  251  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  72.67 
 
 		 164 aa  249  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  73.12 
 
 		 167 aa  247  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  75.32 
 
 		 162 aa  246  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  76.88 
 
 		 162 aa  246  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  71.88 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  75.31 
 
 		 161 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  70 
 
 		 163 aa  237  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  68.55 
 
 		 169 aa  231  3e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  66.25 
 
 		 226 aa  223  7e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  67.08 
 
 		 224 aa  220  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  70.59 
 
 		 273 aa  220  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  68.03 
 
 		 160 aa  217  5e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  64.78 
 
 		 169 aa  214  5e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  68.75 
 
 		 167 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  61.25 
 
 		 163 aa  207  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  61.88 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  59.01 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  57.76 
 
 		 163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  59.88 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  59.01 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  59.01 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  59.88 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  59.88 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60 
 
 		 162 aa  190  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  62.34 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  57.14 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  60.39 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  59.09 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  59.09 
 
 		 165 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  58.06 
 
 		 162 aa  184  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  57.79 
 
 		 162 aa  183  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  58.06 
 
 		 162 aa  183  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  58.06 
 
 		 162 aa  183  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  56.96 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  61.29 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  56.96 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  61.69 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  61.69 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  54.66 
 
 		 165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  57.14 
 
 		 163 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  64.49 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  55.9 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2823  NADH dehydrogenase subunit I  64.03 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0530625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01295  NADH dehydrogenase subunit I  63.31 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  61.7 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  61.7 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  60.43 
 
 		 162 aa  176  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  56.79 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 162 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  58.71 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  58.06 
 
 		 169 aa  174  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  56.25 
 
 		 162 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  51.88 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  58.06 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 		 162 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>