More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1047 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  100 
 
 
295 aa  552  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  99.32 
 
 
295 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  95.25 
 
 
295 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  79.73 
 
 
291 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  75.43 
 
 
288 aa  359  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  65.73 
 
 
290 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  62.5 
 
 
290 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  64.26 
 
 
290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  74.05 
 
 
288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  61.81 
 
 
289 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  62.59 
 
 
290 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  62.94 
 
 
291 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  63.29 
 
 
290 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  65.05 
 
 
288 aa  325  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  59.38 
 
 
289 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  65.96 
 
 
290 aa  316  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  61.4 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  61.89 
 
 
289 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  62.27 
 
 
300 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  61.54 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  62.37 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  64.01 
 
 
288 aa  305  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  62.11 
 
 
289 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  55.93 
 
 
299 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  59.17 
 
 
290 aa  291  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  55.48 
 
 
293 aa  290  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  56.66 
 
 
294 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  57.86 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  57.45 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  61.05 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  57.3 
 
 
284 aa  281  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  57.24 
 
 
290 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  57.55 
 
 
284 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  58.68 
 
 
290 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  60.7 
 
 
290 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  58.68 
 
 
290 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  52.22 
 
 
290 aa  264  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  58.01 
 
 
304 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  56.23 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  55.91 
 
 
287 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  47.37 
 
 
284 aa  226  5.0000000000000005e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  59.17 
 
 
295 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  34.33 
 
 
278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  34.33 
 
 
278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.51 
 
 
312 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  31.27 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.68 
 
 
304 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.08 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.96 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.39 
 
 
281 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
278 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.55 
 
 
280 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.67 
 
 
288 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.17 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  32.37 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.17 
 
 
288 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.17 
 
 
288 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.86 
 
 
285 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.3 
 
 
297 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.3 
 
 
297 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.3 
 
 
297 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  31.33 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.42 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.09 
 
 
285 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.14 
 
 
277 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  31.62 
 
 
351 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.77 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  33.57 
 
 
276 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.06 
 
 
286 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.43 
 
 
290 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  29.68 
 
 
285 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  29.18 
 
 
415 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.43 
 
 
290 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  31.88 
 
 
282 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.04 
 
 
300 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  29.54 
 
 
294 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  33.2 
 
 
291 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.93 
 
 
278 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.93 
 
 
278 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  26.84 
 
 
280 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  31.42 
 
 
312 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  31.86 
 
 
466 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  29.86 
 
 
278 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  29.43 
 
 
306 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  31.91 
 
 
279 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  33.97 
 
 
295 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  28.17 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  28.21 
 
 
281 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  26.94 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  27.76 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  34.27 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  33.86 
 
 
274 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  28.41 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  31.34 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  28.57 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  28.41 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  30.04 
 
 
290 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  26.32 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>