267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1040 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1040  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
441 aa  862    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0318758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  97.96 
 
 
441 aa  813    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0970  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  90.48 
 
 
441 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2159  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  78.75 
 
 
441 aa  630  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3124  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  78.29 
 
 
438 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  76.83 
 
 
447 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.67 
 
 
441 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.45 
 
 
445 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.445117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0333  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.06 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.19 
 
 
441 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.551966  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.19 
 
 
441 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301435  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3518  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.95 
 
 
422 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.19647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.29 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.748886  normal  0.0205845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.06 
 
 
453 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2373  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.82 
 
 
453 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.1 
 
 
441 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3154  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.56 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2219  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.04 
 
 
438 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.867959  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2541  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58 
 
 
429 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.97 
 
 
441 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0766234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2313  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.62 
 
 
453 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.25 
 
 
431 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198297  normal  0.0303559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3359  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.17 
 
 
460 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2123  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.75 
 
 
435 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226797  hitchhiker  0.00769752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1889  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.92 
 
 
436 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.659609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.03 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.138174 
 
 
-
 
NC_004310  BR1296  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.34 
 
 
436 aa  362  8e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.45 
 
 
436 aa  359  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.913176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.8 
 
 
436 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0244195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2623  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.74 
 
 
436 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0367802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.74 
 
 
454 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.57 
 
 
464 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0224312  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.42 
 
 
450 aa  289  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.95 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0926  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.43 
 
 
482 aa  286  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4184  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.72 
 
 
460 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.2 
 
 
464 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.63 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.81 
 
 
458 aa  274  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1850  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.5 
 
 
454 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2890  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.34 
 
 
463 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.66 
 
 
489 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3894  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.5 
 
 
460 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0538501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.16 
 
 
465 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.35 
 
 
454 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0574  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.36 
 
 
467 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0470  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.86 
 
 
462 aa  263  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.35 
 
 
460 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3750  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.92 
 
 
437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.95 
 
 
465 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000497962  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.48 
 
 
441 aa  258  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.328334  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1651  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.29 
 
 
436 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0243  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.89 
 
 
463 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2056  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.68 
 
 
455 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  40.45 
 
 
457 aa  257  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4466  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.56 
 
 
430 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.360132  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2607  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.66 
 
 
454 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.68 
 
 
454 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2119  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.68 
 
 
455 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0264172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0635  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.51 
 
 
467 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873806  normal  0.509374 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.21 
 
 
460 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1001  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.89 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5366  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.14 
 
 
465 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.31 
 
 
463 aa  253  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0327  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.81 
 
 
440 aa  253  6e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.580612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4034  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.86 
 
 
427 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.28 
 
 
502 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09381  putative cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.88 
 
 
475 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101452 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2367  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.39 
 
 
444 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2254  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.66 
 
 
538 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1187  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  38.87 
 
 
439 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0036  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.08 
 
 
460 aa  249  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_135  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.36 
 
 
463 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.75 
 
 
480 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.78 
 
 
434 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0277  glutamine amidotransferase  39.91 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.78 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2191  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  36.43 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2785  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  41.35 
 
 
452 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2157  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.7 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2211  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.7 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.7 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1722  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  33.1 
 
 
454 aa  243  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3157  glutamine amidotransferase  39.68 
 
 
434 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2257  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.47 
 
 
459 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4799  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.75 
 
 
437 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0305873  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2297  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.76 
 
 
557 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368045  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1380  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.86 
 
 
452 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1702  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.65 
 
 
441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21180  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) /cobyrinate a,c-diamide synthase  40.36 
 
 
466 aa  239  5.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2672  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.84 
 
 
467 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.29 
 
 
474 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000112468  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2158  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  35.73 
 
 
439 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1551  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.95 
 
 
435 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.68 
 
 
468 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.005379 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.66 
 
 
443 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.03 
 
 
510 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3350  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.69 
 
 
461 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.95 
 
 
456 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3938  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.36 
 
 
473 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>