59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1017 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  99.54 
 
 		 217 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  82.03 
 
 		 217 aa  345  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  75.85 
 
 		 203 aa  248  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  75.85 
 
 		 203 aa  248  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  38.1 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 188 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  41.62 
 
 		 269 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  41.62 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  41.62 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  41.62 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  41.62 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  41.62 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  41.62 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  37.5 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  37.5 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  39.34 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  42.24 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  43.15 
 
 		 149 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  35.42 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  32.14 
 
 		 347 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  33.12 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  32.93 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  36.43 
 
 		 363 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  34.53 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  30.28 
 
 		 395 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  35.11 
 
 		 350 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  32.41 
 
 		 376 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  31.75 
 
 		 370 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5009  membrane protein, TIGR01666  26.24 
 
 		 732 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0514  intergral membrane protein, YccS:integral membrane protein, YccS/YhfK  26.24 
 
 		 732 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0462  hypothetical protein  24.37 
 
 		 345 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000893155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3247  integral membrane protein, YccS/YhfK  32.82 
 
 		 733 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0450  hypothetical protein  24.37 
 
 		 345 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.376108  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1080  FlhB domain-containing protein  23.49 
 
 		 649 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.990199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  34.75 
 
 		 363 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.93 
 
 		 724 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3693  integral membrane protein, YccS/YhfK family  31.75 
 
 		 725 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427108 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  24.67 
 
 		 717 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.11 
 
 		 697 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  29.29 
 
 		 712 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2038  membrane protein-like protein  30.65 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0752149  normal  0.0532499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  29.29 
 
 		 712 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  31.45 
 
 		 733 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  26.98 
 
 		 731 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3202  hypothetical protein  28.57 
 
 		 712 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000417121  normal  0.0366922 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25 
 
 		 730 aa  42  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  26.47 
 
 		 717 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  26.79 
 
 		 364 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.56 
 
 		 746 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  26.47 
 
 		 717 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  26.47 
 
 		 717 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  26.47 
 
 		 717 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  26.47 
 
 		 717 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.54 
 
 		 688 aa  41.6  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24.67 
 
 		 717 aa  41.6  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>