194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1015 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  98.52 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  89.6 
 
 		 203 aa  377  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  60.4 
 
 		 203 aa  271  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  60.89 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  63.13 
 
 		 208 aa  267  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  52 
 
 		 204 aa  250  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  51.5 
 
 		 204 aa  248  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  57.54 
 
 		 181 aa  230  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  52.76 
 
 		 203 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  54.95 
 
 		 192 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  50.5 
 
 		 203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  55.49 
 
 		 194 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  55.49 
 
 		 194 aa  208  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  48.42 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  51.34 
 
 		 192 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  46.32 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  29.8 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  31.18 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  29.89 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  40.51 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  39.24 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  39.24 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.05 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.47 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  30.93 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0416  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0726879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  34.57 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  32.53 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  32.61 
 
 		 96 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  29.17 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  30.49 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1040  isochorismatase hydrolase  38.95 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  25.62 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  34.51 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  26.44 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1540  isochorismatase hydrolase  27.39 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00288771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1166  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  36.23 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  31.48 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.21 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  38.75 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1095  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  35.38 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  35.38 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  30.34 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 233 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  35.38 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1088  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  30.34 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  30.34 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  30.34 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  30.95 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>