More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0966 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  100 
 
 		 126 aa  257  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  257  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  99.21 
 
 		 126 aa  256  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  91.06 
 
 		 126 aa  233  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  91.06 
 
 		 126 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  94.17 
 
 		 123 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  80.33 
 
 		 123 aa  213  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  76.23 
 
 		 134 aa  206  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  76.23 
 
 		 123 aa  206  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  77.05 
 
 		 123 aa  206  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  78.69 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  77.87 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  80.17 
 
 		 121 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  79.34 
 
 		 121 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  80.17 
 
 		 121 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  77.87 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  80 
 
 		 144 aa  204  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  78.51 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  79.34 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  77.5 
 
 		 124 aa  203  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  76.86 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  76.23 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  76.23 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  76.86 
 
 		 121 aa  200  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  76.86 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  76.67 
 
 		 127 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  73.77 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 126 aa  190  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  65 
 
 		 121 aa  167  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 		 1274 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  47.2 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1977 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  49.51 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1271 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.63 
 
 		 948 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1352 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  35.29 
 
 		 497 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1070 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1245 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  39.84 
 
 		 762 aa  94.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  35.65 
 
 		 742 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 902 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 1316 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 1172 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 1007 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.29 
 
 		 763 aa  92  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  40.68 
 
 		 847 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  38.02 
 
 		 248 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.52 
 
 		 933 aa  90.5  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 993 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 995 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 397 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.14 
 
 		 666 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 869 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.5 
 
 		 930 aa  88.6  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.5 
 
 		 921 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 1792 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.5 
 
 		 942 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  34.68 
 
 		 1626 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  36.51 
 
 		 1574 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  37.39 
 
 		 1297 aa  87.8  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1016 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 1313 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 899 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 929 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1096 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50640  response regulator with metal dependent phosphohydrolase activity (two-component)  41.8 
 
 		 347 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>