More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0955 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  96.12 
 
 		 361 aa  664    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 361 aa  721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  87.53 
 
 		 361 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 361 aa  721    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  82.78 
 
 		 359 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  82.5 
 
 		 359 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  70.82 
 
 		 360 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  70.9 
 
 		 358 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  65.08 
 
 		 358 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  65.18 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  64.27 
 
 		 361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  62.88 
 
 		 361 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  64.21 
 
 		 361 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  63.71 
 
 		 361 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  64.67 
 
 		 360 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  62.12 
 
 		 359 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  63.51 
 
 		 359 aa  447  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  62.12 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  63.06 
 
 		 359 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  61.84 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  62.5 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0512  peptide chain release factor 1  62.33 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  60.45 
 
 		 359 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  61 
 
 		 359 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  61.24 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  61.47 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  61.11 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  59.27 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  60.39 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  58.22 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  57.66 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  57.66 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  57.3 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  62.24 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  57.94 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  58.99 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  60.62 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  58.28 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  57.3 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 363 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 362 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 362 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  60.62 
 
 		 351 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 363 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 		 361 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  55.28 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1053  peptide chain release factor 1  55.74 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.520226  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  57.14 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  57.87 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  59.44 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  55.21 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 		 361 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  63.78 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 362 aa  391  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1913  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  54.11 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0136  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.056338  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  56.74 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  54.62 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  57.43 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  54.44 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  52.82 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0646  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.308235  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  54.26 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  56.66 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1971  peptide chain release factor 1  56.67 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00228451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1907  peptide chain release factor 1  56.67 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0341026  normal  0.709349 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0148  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.570569  normal  0.18601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1547  peptide chain release factor 1  56.67 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891695  normal  0.256018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  55.06 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>