More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0954 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  98.31 
 
 
296 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  84.46 
 
 
296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  61.25 
 
 
299 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  57.14 
 
 
299 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  56.47 
 
 
295 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.87 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  52.05 
 
 
298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.08 
 
 
286 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  51.37 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  48.71 
 
 
286 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  49.47 
 
 
295 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  49.45 
 
 
292 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  51.59 
 
 
317 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  48.91 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  49.28 
 
 
283 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  45.76 
 
 
319 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  47.79 
 
 
293 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.6 
 
 
296 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  47.6 
 
 
325 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.39 
 
 
306 aa  205  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  49.26 
 
 
292 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.95 
 
 
285 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.35 
 
 
283 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  46.9 
 
 
287 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  44.96 
 
 
283 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  45.59 
 
 
276 aa  195  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  43.49 
 
 
297 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  51.24 
 
 
289 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  43.82 
 
 
288 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  47.89 
 
 
280 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  49.33 
 
 
274 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  47.89 
 
 
280 aa  185  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  46.92 
 
 
286 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  44.81 
 
 
278 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  41.34 
 
 
284 aa  178  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.46 
 
 
279 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  43.88 
 
 
287 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.44 
 
 
293 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  33.09 
 
 
280 aa  176  4e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  41.05 
 
 
301 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  45.11 
 
 
289 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  40.07 
 
 
295 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  36.1 
 
 
288 aa  175  9e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  45 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  43.77 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  41.76 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  44.07 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.54 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  42.8 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  40.07 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  42.75 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  42.01 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.69 
 
 
285 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  42.37 
 
 
302 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.97 
 
 
286 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  33.09 
 
 
280 aa  169  4e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  42.21 
 
 
284 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.3 
 
 
289 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.4 
 
 
288 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  39.69 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  40.71 
 
 
280 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  46.57 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.44 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  40.3 
 
 
284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  36.93 
 
 
285 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  42.66 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.47 
 
 
276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.69 
 
 
283 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.08 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  37.19 
 
 
285 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.81 
 
 
307 aa  162  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  44.55 
 
 
274 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  41.26 
 
 
294 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.69 
 
 
276 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  45.59 
 
 
283 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  44.15 
 
 
291 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  40.68 
 
 
289 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.06 
 
 
275 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  45.37 
 
 
295 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  45.49 
 
 
278 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  38.19 
 
 
304 aa  158  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  32.43 
 
 
279 aa  158  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  41.32 
 
 
281 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  40.83 
 
 
289 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  42.31 
 
 
274 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  38.2 
 
 
282 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.86 
 
 
281 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.12 
 
 
276 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  42.25 
 
 
306 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  45.81 
 
 
276 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  43.3 
 
 
275 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  43.68 
 
 
276 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  38.13 
 
 
284 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.44 
 
 
280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  44.06 
 
 
280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  39.69 
 
 
285 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  42.15 
 
 
270 aa  155  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  38.7 
 
 
277 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>