22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0906 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0906  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00446262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0867  hypothetical protein  99.32 
 
 		 146 aa  285  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.33158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0835  hypothetical protein  84.25 
 
 		 146 aa  228  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.165946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4719  hypothetical protein  55.04 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4205  hypothetical protein  51.94 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3545  hypothetical protein  55.68 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6281  hypothetical protein  55.43 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5264  hypothetical protein  54.32 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160969  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1112  hypothetical protein  49.41 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6213  hypothetical protein  49.5 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.357243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1361  hypothetical protein  43.24 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185984  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3303  hypothetical protein  54.65 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1068  hypothetical protein  49.41 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1255  hypothetical protein  47.06 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1574  hypothetical protein  53.16 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5242  hypothetical protein  51.85 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0925743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0047  hypothetical protein  47.73 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1289  hypothetical protein  47.73 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3865  hypothetical protein  47.06 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0308026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3483  hypothetical protein  43.53 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3791  hypothetical protein  43.53 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239654 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1750  hypothetical protein  40.82 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00302655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>