More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0857 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0816  8-amino-7-oxononanoate synthase  99.48 
 
 
383 aa  737    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.497874  normal  0.203864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0857  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
383 aa  741    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0484111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0781  8-amino-7-oxononanoate synthase  90.84 
 
 
387 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.054688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6357  8-amino-7-oxononanoate synthase  75.47 
 
 
379 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0866  8-amino-7-oxononanoate synthase  74.8 
 
 
374 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5168  8-amino-7-oxononanoate synthase  75.47 
 
 
379 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206563  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2875  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.32 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.43 
 
 
395 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2132  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.93 
 
 
350 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1868  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.46 
 
 
381 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.81 
 
 
386 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1346  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.97 
 
 
392 aa  363  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.0485323 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0950  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.37 
 
 
367 aa  288  2e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0171  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.55 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.1403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.38 
 
 
384 aa  283  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.81 
 
 
391 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.82 
 
 
397 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3452  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.26 
 
 
397 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.09 
 
 
398 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.09 
 
 
398 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.23 
 
 
397 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.48 
 
 
384 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.11 
 
 
391 aa  269  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.5 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.45 
 
 
394 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.78 
 
 
396 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.28 
 
 
381 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.36 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.18 
 
 
386 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.29 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.45 
 
 
392 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.22 
 
 
389 aa  255  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.24 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.19 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.54 
 
 
391 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.72 
 
 
401 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  39.52 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.72 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.7 
 
 
390 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.26 
 
 
395 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.13 
 
 
387 aa  250  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.28 
 
 
396 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.85 
 
 
407 aa  250  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.25 
 
 
380 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.55 
 
 
396 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.29 
 
 
404 aa  248  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.08 
 
 
389 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
389 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.58 
 
 
392 aa  247  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.19 
 
 
396 aa  245  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.64 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.13 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.48 
 
 
392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.59 
 
 
383 aa  243  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.24 
 
 
390 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.78 
 
 
390 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  37.85 
 
 
396 aa  240  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.97 
 
 
387 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.56 
 
 
390 aa  239  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.41 
 
 
397 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.53 
 
 
395 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.86 
 
 
394 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.95 
 
 
387 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  38.44 
 
 
395 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.17 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.51 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.94 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.53 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.2 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.56 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.48 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.56 
 
 
399 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.25 
 
 
395 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.5 
 
 
390 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.73 
 
 
391 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.96 
 
 
396 aa  232  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.51 
 
 
395 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.74 
 
 
385 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.24 
 
 
393 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.64 
 
 
391 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.73 
 
 
384 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.85 
 
 
385 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.99 
 
 
395 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.26 
 
 
395 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.63 
 
 
400 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.73 
 
 
395 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0886  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.78 
 
 
370 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.73 
 
 
395 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.73 
 
 
395 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1393  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.98 
 
 
387 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.92 
 
 
399 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.71 
 
 
391 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.16 
 
 
393 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.88 
 
 
370 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.78 
 
 
395 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.11 
 
 
370 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  37.29 
 
 
403 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.57 
 
 
386 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0031  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.78 
 
 
395 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>