More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0767 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0767  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  86.18 
 
 		 255 aa  224  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  85.37 
 
 		 255 aa  223  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  83.74 
 
 		 255 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  83.74 
 
 		 255 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  83.74 
 
 		 255 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2966  transposase  60.19 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3679  transposase  81.54 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  40.34 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  40.34 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  40.34 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  36.13 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  36.13 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  38.66 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  38.66 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  33.87 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  33.87 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  33.87 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  33.87 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  33.87 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  33.87 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  33.87 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  33.87 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  33.87 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  39.67 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  39.67 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  34.06 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  33.33 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  38.66 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  38.66 
 
 		 186 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3275  transposase IS4 family protein  33.8 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  38.66 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  38.66 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0563  hypothetical protein  35.59 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  35.29 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  37.82 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  37.82 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.77 
 
 		 281 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.77 
 
 		 281 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  36.97 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  33.33 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  36.36 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  34.45 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  34.45 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  35.77 
 
 		 266 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0291  transposase (IS4 family)  34.35 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.34578e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  35.77 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  35.77 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  34.45 
 
 		 190 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00500  transposase  34.15 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  33.33 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00557  transposase  33.33 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  35.77 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  35.77 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  35.77 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  35.77 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  35.77 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  35.77 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  46.43 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0242  transposase (IS4 family)  34.09 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.77 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.04 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0124  transposase (IS4 family)  34.09 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  34.13 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>