18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0749 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4057  hypothetical protein  71.17 
 
 		 111 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0486506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1727  hypothetical protein  62.75 
 
 		 111 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0725  hypothetical protein  43.52 
 
 		 111 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3258  hypothetical protein  48.6 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317122  normal  0.791915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0035  hypothetical protein  44.04 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0270  hypothetical protein  39.62 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  34.02 
 
 		 339 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2886  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2663  hypothetical protein  33.04 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.525352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1792  hypothetical protein  27.91 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1088  hypothetical protein  30.84 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469359  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5911  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1838  LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1872  LuxR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1947  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 119 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2168  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2057  LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 137 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.773871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>