52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0746 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  663    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  29.3 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  32.35 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  31.05 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  32.24 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  27.65 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  27.65 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  31.16 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  31.29 
 
 		 470 aa  72.8  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  32.35 
 
 		 638 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  34.59 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  27.84 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  36.11 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  31.71 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  28.75 
 
 		 539 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  29.93 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  26.88 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  30.57 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  26.77 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  28.25 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  21.98 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  28.65 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  25.87 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  29.01 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  26.95 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  26.18 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  36.59 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  28.89 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  27.86 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  35 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  25.51 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  23.76 
 
 		 379 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  24.85 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  25.13 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  26.42 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  33.01 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  27.66 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  25.17 
 
 		 363 aa  50.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  27.92 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  27.92 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  31.06 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  41.94 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  27.78 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  28.79 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  27.66 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  26.57 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  31.25 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  40 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  27.92 
 
 		 458 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  29.61 
 
 		 617 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  25.14 
 
 		 589 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  40.62 
 
 		 402 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>