More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0724 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 408 aa  818    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  72.77 
 
 		 398 aa  571  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  55.03 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  52.45 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  48.65 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  50.89 
 
 		 351 aa  348  9e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  47.86 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  43.39 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  46.68 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  46.84 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  37.59 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  38.48 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  37.21 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  37.28 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  35.11 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  36.95 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  36.95 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  38.3 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  39.89 
 
 		 424 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  34.35 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  36.22 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  39.83 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  35.71 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  37.74 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  33.93 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  37.91 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  32.54 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  37.5 
 
 		 402 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  35.96 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  37.01 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.17 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  33.52 
 
 		 380 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  34.64 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  32.47 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  36.34 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  31.52 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 		 415 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  35.84 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  32.05 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  30.53 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  32.81 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  35.58 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  31.14 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  28.08 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  29.6 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  33.69 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  33.82 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  29.94 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  31.38 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  29.43 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  30.15 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  27.84 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.18 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  30.09 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.35 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  28.78 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  27.74 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  30.23 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  28.41 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.38 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.44 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.31 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.92 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  27.66 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  20.99 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  26.86 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.11 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.87 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.18 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  31.88 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  24.68 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  25.96 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  24.39 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  24.42 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  27.6 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  26.74 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  25.9 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  30.5 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  25.49 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.12 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.24 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.03 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  26.18 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  24.16 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  27.18 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  27.76 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  23.85 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  26.97 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.1 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  23.51 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  30.65 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  26.98 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0544698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>