20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0679 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  362  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0690  hypothetical protein  94.18 
 
 		 189 aa  298  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154988  normal  0.145005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  80.11 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.344221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  41.77 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  39.56 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  38.46 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  38.46 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  42.59 
 
 		 349 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  44.44 
 
 		 305 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  38.89 
 
 		 293 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  40.48 
 
 		 290 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  31.82 
 
 		 161 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  40.68 
 
 		 323 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  37.84 
 
 		 362 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  40.91 
 
 		 297 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  36.59 
 
 		 325 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  25.58 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3584  hypothetical protein  32.08 
 
 		 166 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.26 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>