242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0575 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  96.38 
 
 		 442 aa  802    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  100 
 
 		 442 aa  854    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  82.77 
 
 		 450 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  72.05 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  66.35 
 
 		 458 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  70.55 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  35.16 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  36.47 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  37.26 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  34.97 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  36.6 
 
 		 414 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  35.18 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  34.2 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  37.81 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  31.99 
 
 		 463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  33.83 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  34.28 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  34.87 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.18 
 
 		 435 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  34.21 
 
 		 422 aa  140  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  32.91 
 
 		 450 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  38.64 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  35.96 
 
 		 504 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  33.8 
 
 		 419 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.61 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 		 476 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  34.57 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.38 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  33.33 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  33.84 
 
 		 456 aa  126  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  29.13 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  33.09 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  33.8 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  28.54 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  29.83 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  34.76 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  33.78 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.82 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  29.14 
 
 		 424 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  34.68 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  30.68 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  29.95 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  30.05 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  29.55 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  29.6 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  28.89 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  30.85 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  30.12 
 
 		 1199 aa  100  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  28.77 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  28.89 
 
 		 468 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  28.17 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.29 
 
 		 413 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  29.33 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  28.43 
 
 		 412 aa  87.8  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  35.21 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  27.14 
 
 		 628 aa  83.2  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  33.33 
 
 		 411 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  22.91 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  27.08 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  32.79 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  30.98 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  25.45 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  30.43 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  27.75 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  25.16 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  29.36 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  29.73 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.21 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  25.55 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.6 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  30.03 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  28.04 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  33.33 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  24.48 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  45.26 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45.26 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.2 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  46.15 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  34.67 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  26.32 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  33.09 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  26.35 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  26.35 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  55.17 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  29.64 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  30.74 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  28.16 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.84 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  24.84 
 
 		 494 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  37.11 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  44.87 
 
 		 510 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  49.09 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  47.27 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  25.85 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  50.91 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 578 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>