192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0521 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
375 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  70.85 
 
 
353 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  76.85 
 
 
339 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  67.7 
 
 
354 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  50.44 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  48.19 
 
 
348 aa  299  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  49.23 
 
 
366 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  48.71 
 
 
355 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  50 
 
 
355 aa  288  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  49.33 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  48.36 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  43.71 
 
 
384 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  45.03 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  41.52 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  40.91 
 
 
353 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  44.84 
 
 
381 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  35.24 
 
 
340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  35.68 
 
 
355 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  36.36 
 
 
342 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
335 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
335 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  33.48 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  33.04 
 
 
335 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  34.29 
 
 
358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  33.04 
 
 
355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 
365 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  36.87 
 
 
340 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  35.64 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  31.96 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.67 
 
 
672 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.22 
 
 
701 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  28.34 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.72 
 
 
744 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.77 
 
 
650 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.82 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  27.46 
 
 
758 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.19 
 
 
758 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  27.46 
 
 
758 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 
645 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
593 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.41 
 
 
656 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 
575 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 
575 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.42 
 
 
575 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
643 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  31.14 
 
 
558 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
641 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 
712 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  28 
 
 
636 aa  60.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.74 
 
 
622 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 
729 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.63 
 
 
618 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 
632 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  26.6 
 
 
760 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  31.94 
 
 
571 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
756 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.58 
 
 
618 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  26.92 
 
 
701 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.93 
 
 
658 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
459 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 
724 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.37 
 
 
723 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  24.88 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.99 
 
 
1089 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.17 
 
 
737 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.67 
 
 
701 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.48 
 
 
764 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 
858 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.65 
 
 
759 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.32 
 
 
723 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  24.46 
 
 
632 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  32.72 
 
 
586 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  28.65 
 
 
589 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 
641 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
699 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 
574 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 
572 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.77 
 
 
440 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
702 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 
675 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.73 
 
 
753 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.63 
 
 
859 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  29.01 
 
 
464 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  24.22 
 
 
752 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  24.67 
 
 
725 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  23.89 
 
 
284 aa  53.5  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.6 
 
 
500 aa  53.1  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 
479 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 
421 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 
740 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  26.7 
 
 
592 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  26.89 
 
 
651 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  25 
 
 
971 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>