More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0425 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  100 
 
 
408 aa  834    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  79.41 
 
 
408 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0332  Beta-ketoacyl synthase  80.39 
 
 
407 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.207835 
 
 
-
 
NC_004310  BR2172  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.2 
 
 
407 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0068  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  78.5 
 
 
399 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.707372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0383  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  87.5 
 
 
408 aa  741    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0033  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.88 
 
 
407 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  87.25 
 
 
408 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413465  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2084  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.2 
 
 
407 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0612  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  77.94 
 
 
408 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0348  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  77.45 
 
 
408 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0221  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  78.19 
 
 
408 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0041  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.15 
 
 
407 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0458  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  99.26 
 
 
408 aa  830    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2205  Beta-ketoacyl synthase  76.96 
 
 
407 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1269  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  76.49 
 
 
406 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0740  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  81.19 
 
 
407 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  88.97 
 
 
408 aa  756    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376136  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0053  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.88 
 
 
407 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0495  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  96.81 
 
 
408 aa  812    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0230579  normal  0.158439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3938  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  73.09 
 
 
406 aa  598  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0180  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  72.91 
 
 
407 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3449  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  71.36 
 
 
406 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4057  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.68 
 
 
410 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5061  Beta-ketoacyl synthase  69.78 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4379  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  69.19 
 
 
410 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.913826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3635  Beta-ketoacyl synthase  68.87 
 
 
408 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2879  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  65.59 
 
 
406 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1009  beta-ketoacyl synthase  65.68 
 
 
409 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  65.76 
 
 
404 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  62.13 
 
 
403 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1422  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  61.88 
 
 
411 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484901  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0456  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  63.86 
 
 
405 aa  513  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1487  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  61.63 
 
 
411 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000399057  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1475  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  61.63 
 
 
411 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896879  normal  0.430163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1650  beta-ketoacyl synthase  64.94 
 
 
409 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2840  Beta-ketoacyl synthase  62.13 
 
 
411 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  decreased coverage  0.0000909271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4242  Beta-ketoacyl synthase  61.27 
 
 
404 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0417554  hitchhiker  0.0000000109477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1071  3-ketoacyl-ACP synthase FabB  61.76 
 
 
403 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.791562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1613  Beta-ketoacyl synthase  62.13 
 
 
411 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000687421  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2746  beta-ketoacyl synthase  62.13 
 
 
411 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  62.38 
 
 
403 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000914217  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASI  62.38 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000108179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03105  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  62.01 
 
 
403 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2763  Beta-ketoacyl synthase  61.63 
 
 
411 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000380167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2445  beta-ketoacyl synthase  61.63 
 
 
411 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000400584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1693  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  62.13 
 
 
403 aa  504  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000193384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  62.38 
 
 
407 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0998  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  60.78 
 
 
405 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000357653  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2019  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.38 
 
 
407 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383938  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1777  Beta-ketoacyl synthase  62.96 
 
 
412 aa  498  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1482  beta-ketoacyl synthase  60.89 
 
 
403 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000201654  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0181  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  61.73 
 
 
409 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3935  hypothetical protein  64.94 
 
 
409 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408211  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01194  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  63.61 
 
 
404 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3807  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  60.89 
 
 
403 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2410  beta-ketoacyl synthase  60.89 
 
 
403 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000023213  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1391  beta-ketoacyl synthase  60.15 
 
 
412 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1995  beta-ketoacyl synthase  60.89 
 
 
404 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29060  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.48 
 
 
405 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.39 
 
 
406 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0542  Beta-ketoacyl synthase  61.63 
 
 
407 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1656  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  61.73 
 
 
409 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0361751  normal  0.598458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3498  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.64 
 
 
406 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0526  beta-ketoacyl synthase  61.63 
 
 
407 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38393  normal  0.0451543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.14 
 
 
405 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4175  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.64 
 
 
406 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40794  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1693  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.64 
 
 
406 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.89 
 
 
405 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1606  Beta-ketoacyl synthase  59.65 
 
 
424 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000886766  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1373  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  59.21 
 
 
405 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3746  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.89 
 
 
406 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3177  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  63.95 
 
 
409 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1945  Beta-ketoacyl synthase  60.49 
 
 
406 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153136  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3914  beta-ketoacyl synthase  63.95 
 
 
409 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1893  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  60.64 
 
 
407 aa  485  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.4 
 
 
406 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409355  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1274  Beta-ketoacyl synthase  59.9 
 
 
407 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0018  beta-ketoacyl synthase  58.23 
 
 
405 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1644  beta-ketoacyl synthase  59.65 
 
 
403 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00348297  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3008  Beta-ketoacyl synthase  59.55 
 
 
403 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.753979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4180  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  60.34 
 
 
408 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.38459  normal  0.310859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3383  beta-ketoacyl synthase  63.12 
 
 
404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.160836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2585  Beta-ketoacyl synthase  59.26 
 
 
405 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2871  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  59.66 
 
 
405 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261855  normal  0.0659143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02248  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  60.59 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1333  Beta-ketoacyl synthase  60.59 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2474  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.59 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2480  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.59 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0453  Beta-ketoacyl synthase  57.78 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2701  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.34 
 
 
406 aa  458  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2805  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  58.33 
 
 
405 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.858118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02208  hypothetical protein  60.59 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1329  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.59 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318375  normal  0.654586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1459  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  58.33 
 
 
405 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0426777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3464  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.59 
 
 
406 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  56.79 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.956825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2618  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.59 
 
 
406 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1359  Beta-ketoacyl synthase  59.36 
 
 
406 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.272883  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0983  Beta-ketoacyl synthase  58.66 
 
 
405 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.521852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>