145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0376 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  99.36 
 
 
313 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  100 
 
 
326 aa  668    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  95.62 
 
 
275 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  73.36 
 
 
280 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  72.04 
 
 
283 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  72 
 
 
283 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  48 
 
 
287 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0234  hypothetical protein  36.13 
 
 
275 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160183  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  32.72 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3000  FkbM family methyltransferase  30.71 
 
 
288 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.22275  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  31.47 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  31.25 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  29.83 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2361  FkbM family methyltransferase  27.61 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000541582  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  30.73 
 
 
256 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  35.34 
 
 
921 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0295  methyltransferase FkbM  33.91 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5961  methyltransferase FkbM family  33.82 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0180421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5205  methyltransferase FkbM family  33.8 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  28.28 
 
 
625 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  30.07 
 
 
306 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1716  FkbM family methyltransferase  33.91 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  37.23 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7105  methyltransferase FkbM family  33.58 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  24.57 
 
 
488 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0764  methyltransferase FkbM  34.43 
 
 
283 aa  63.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0124652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  28.57 
 
 
256 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4554  FkbM family methyltransferase  33.55 
 
 
263 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.02089  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  30.05 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  28.99 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3423  FkbM family methyltransferase  25.71 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0570785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  32.48 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2699  methyltransferase FkbM family  31.39 
 
 
266 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2059  methyltransferase FkbM family  31.45 
 
 
318 aa  59.7  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2370  methyltransferase FkbM  29.76 
 
 
348 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.363109  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  36.3 
 
 
792 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2624  FkbM family methyltransferase  31.78 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  25.85 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  31.75 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1567  FkbM family methyltransferase  32.43 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2165  FkbM family methyltransferase  32 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07250  hypothetical protein  29.01 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  27.01 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  32.79 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5723  FkbM family methyltransferase  35.62 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0496638  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  26.6 
 
 
271 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  30.5 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2773  FkbM family methyltransferase  31.4 
 
 
263 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1244  methyltransferase FkbM  27.27 
 
 
254 aa  56.2  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0484  FkbM family methyltransferase  29.31 
 
 
707 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1183  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 
861 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  30.83 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  31.03 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  27.97 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1453  FkbM family methyltransferase  31.97 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214095  hitchhiker  0.000083365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2734  methyltransferase FkbM family  31.82 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6633  FkbM family methyltransferase  30.24 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00015631  hitchhiker  0.000119437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0435  FkbM family methyltransferase  28.4 
 
 
657 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4276  methyltransferase FkbM  32.14 
 
 
239 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00443119  normal  0.49625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4516  FkbM family methyltransferase  31.43 
 
 
277 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  23.35 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  29.86 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  27.22 
 
 
278 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2953  methyltransferase FkbM family  27.56 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  32.31 
 
 
239 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4064  FkbM family methyltransferase  28.73 
 
 
237 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345765  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1299  methyltransferase FkbM  28.57 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.71332  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  32 
 
 
416 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2636  RfbT protein  26.35 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  31.37 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1852  methyltransferase FkbM family  34.92 
 
 
297 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  30.99 
 
 
351 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6324  methyltransferase FkbM family  27.85 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  30.33 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  25.53 
 
 
415 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0618  FkbM family methyltransferase  29.71 
 
 
232 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5295  hypothetical protein  28.92 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.090256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6684  putative methyltransferase  31.3 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  24.65 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3035  methyltransferase FkbM  29.85 
 
 
235 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0310  methyltransferase FkbM  32.37 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  24.65 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  25.68 
 
 
723 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2093  methyltransferase FkbM  29.37 
 
 
252 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0475221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  26.45 
 
 
265 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5570  methyltransferase FkbM family  28.65 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2470  FkbM family methyltransferase  31.61 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036877  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1485  FkbM family methyltransferase  30 
 
 
376 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80434 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1608  methyltransferase FkbM family  28.23 
 
 
365 aa  47.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  26.88 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3318  methyltransferase  25.19 
 
 
451 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1459  methyltransferase FkbM family  28.99 
 
 
301 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3578  methyltransferase  25.19 
 
 
446 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2760  methyltransferase FkbM family  31.15 
 
 
264 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  hitchhiker  0.00553627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3278  methyltransferase FkbM family  30.56 
 
 
238 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1323  FkbM family methyltransferase  26.95 
 
 
257 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0619476  hitchhiker  0.000000000782975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3281  methyltransferase  24.43 
 
 
451 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3233  SAM-dependent methyltransferase  24.43 
 
 
451 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  28.06 
 
 
265 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>