More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0306 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  84.54 
 
 		 418 aa  693    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  869    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  84.73 
 
 		 421 aa  693    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  99.28 
 
 		 419 aa  824    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  94.75 
 
 		 419 aa  772    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  86.16 
 
 		 416 aa  728    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  72.18 
 
 		 403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  68.12 
 
 		 418 aa  551  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  70.93 
 
 		 418 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  62.29 
 
 		 421 aa  491  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  60.63 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 417 aa  292  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  41.73 
 
 		 404 aa  286  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  41.18 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  41.84 
 
 		 404 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 414 aa  279  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  43.32 
 
 		 403 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  41.34 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  40.83 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  40.82 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  42.09 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  40.31 
 
 		 403 aa  246  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  42.09 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  42.17 
 
 		 403 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  41.67 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  41.84 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  41.18 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  37.11 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 412 aa  226  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  32.68 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  33.41 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  33.41 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  33.41 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  33.41 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  33.26 
 
 		 1046 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  32.91 
 
 		 606 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 468 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  30.22 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  27.44 
 
 		 389 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  30.22 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  27.44 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  27.44 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  27.44 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  27.32 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  27.44 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  27.44 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  28.23 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  27.44 
 
 		 389 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  28.97 
 
 		 895 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  27.36 
 
 		 912 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  27.55 
 
 		 431 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 420 aa  143  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  28.88 
 
 		 905 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  30.33 
 
 		 917 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 440 aa  137  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  26.86 
 
 		 436 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 453 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  27.89 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.89 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  27.84 
 
 		 422 aa  133  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  27.63 
 
 		 426 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  32.95 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  32.95 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  27.12 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 472 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>