66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0271 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  42.68 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  39.13 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  33.73 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  39.27 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  45.19 
 
 		 180 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  36.88 
 
 		 345 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  43.12 
 
 		 375 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  39.02 
 
 		 314 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  33.83 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  41.57 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  36.44 
 
 		 304 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  45.08 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  51.65 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  43.17 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  35.43 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  39.1 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  45.63 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  38.16 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  39.53 
 
 		 328 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  35.43 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  37.72 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  46.24 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  36.73 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  35.43 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  39.56 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  34.81 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  44.09 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  40 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  32.35 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  31.75 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  31.29 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  28.68 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  36.9 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4688  restriction endonuclease  29.23 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0822  HNH nuclease  27.47 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499026 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3390  restriction endonuclease-like protein  28.14 
 
 		 496 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  35.37 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  34.52 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  35.8 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  34.94 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  35.29 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  26.06 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0481  hypothetical protein  26.06 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  51.28 
 
 		 59 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  30.95 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  32.58 
 
 		 462 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  26.62 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  38.37 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5799  HNH nuclease  28.83 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.249192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 424 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  34.48 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4818  hypothetical protein  27.93 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4533  hypothetical protein  27.93 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00606682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0581  HNH nuclease  29.5 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.351776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4906  hypothetical protein  27.93 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0295  restriction endonuclease  31.65 
 
 		 374 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.810587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  30 
 
 		 315 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3262  hypothetical protein  32.22 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3143  hypothetical protein  35.87 
 
 		 248 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>