More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0222 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
362 aa  745    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  98.62 
 
 
362 aa  736    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  92.24 
 
 
362 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  71.59 
 
 
359 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  67.45 
 
 
313 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  61.17 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  64.43 
 
 
310 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  45.67 
 
 
316 aa  285  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  47.25 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  45.42 
 
 
318 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  43.33 
 
 
329 aa  276  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  41.49 
 
 
330 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  42.05 
 
 
329 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  41.57 
 
 
342 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  43.05 
 
 
316 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  36.64 
 
 
350 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  36.34 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  36.34 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  38.27 
 
 
351 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 
330 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.5 
 
 
311 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  39.29 
 
 
337 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  37.79 
 
 
337 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  38.96 
 
 
337 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  35.67 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  48.51 
 
 
211 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  36.42 
 
 
399 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  36.18 
 
 
302 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  36.18 
 
 
408 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  38.06 
 
 
288 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  34.35 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  35.43 
 
 
405 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  34.42 
 
 
426 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.97 
 
 
301 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  30.72 
 
 
382 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  29.06 
 
 
444 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  30.72 
 
 
382 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  30.26 
 
 
394 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  28.49 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  33.21 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  33.21 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  29.39 
 
 
384 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  29.53 
 
 
384 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  31.92 
 
 
388 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  30.83 
 
 
346 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  30.49 
 
 
352 aa  123  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  29.25 
 
 
557 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34 
 
 
324 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
531 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 
544 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  36.98 
 
 
243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 
535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  29.95 
 
 
346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  29.44 
 
 
532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  30.8 
 
 
315 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  28.12 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  29.97 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  28.48 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 
326 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  28.77 
 
 
513 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  33.12 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  32.9 
 
 
372 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
321 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  38.32 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  28.12 
 
 
524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  32.9 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  27.25 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  28.85 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  33.18 
 
 
272 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  29.02 
 
 
525 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  29.71 
 
 
349 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  26.8 
 
 
385 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 
355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  28.57 
 
 
338 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  30.62 
 
 
311 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  31.74 
 
 
302 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  31.02 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  33.61 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  30.34 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  28.94 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  28.75 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  46.49 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  29.25 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.44 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  30.47 
 
 
276 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>