17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0167 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0078  hypothetical protein  90.41 
 
 		 399 aa  690    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0085  hypothetical protein  96.11 
 
 		 387 aa  727    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.56108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5541  hypothetical protein  47.85 
 
 		 378 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1614  hypothetical protein  32.57 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0225237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0013  hypothetical protein  35.51 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1300  hypothetical protein  31.05 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061722  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4319  hypothetical protein  29.06 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6764  hypothetical protein  28.42 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167002 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0076  hypothetical protein  26.23 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0235  hypothetical protein  31.52 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01110  hypothetical protein  25.95 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2859  hypothetical protein  36.36 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4379  hypothetical protein  39.13 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01487  hypothetical protein  39.53 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0296  hypothetical protein  32.88 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1263  hypothetical protein  30.11 
 
 		 327 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.118397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>