More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0135 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  100 
 
 		 122 aa  239  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  86.07 
 
 		 122 aa  207  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  65.32 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  63.11 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  74.51 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  70.45 
 
 		 324 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  67.42 
 
 		 342 aa  127  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  65.38 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  65.38 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  65.38 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  68.54 
 
 		 358 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  67.37 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  63.64 
 
 		 360 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  63.64 
 
 		 360 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  64.04 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  68.18 
 
 		 335 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  65.96 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.21 
 
 		 238 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 198 aa  120  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  68.13 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 230 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  68.18 
 
 		 199 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 242 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 230 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 242 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 200 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 211 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  64.37 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 211 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 211 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  61.36 
 
 		 170 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  57.69 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  50.44 
 
 		 270 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  58.06 
 
 		 206 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 200 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  63.86 
 
 		 303 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  52.21 
 
 		 239 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  47.58 
 
 		 286 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 227 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 212 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  54.72 
 
 		 322 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.78 
 
 		 275 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.78 
 
 		 275 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 206 aa  114  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.78 
 
 		 266 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  53 
 
 		 254 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  56.31 
 
 		 163 aa  113  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  50.86 
 
 		 240 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  63.86 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  55.36 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  65 
 
 		 202 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  54.87 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  60.2 
 
 		 249 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  48.65 
 
 		 243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0451  rare lipoprotein A  92.19 
 
 		 64 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  0.956063 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  51.72 
 
 		 261 aa  110  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  60 
 
 		 199 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  65.93 
 
 		 371 aa  110  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  46.49 
 
 		 321 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 179 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  60.49 
 
 		 262 aa  110  6e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 367 aa  110  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 264 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  59.49 
 
 		 270 aa  110  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  58.7 
 
 		 331 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  51.38 
 
 		 224 aa  109  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 221 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  50.91 
 
 		 342 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 263 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  53.57 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  62.96 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  55.79 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  55.79 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  52 
 
 		 249 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  53.21 
 
 		 367 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  53.21 
 
 		 255 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  57.95 
 
 		 341 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 203 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  52.73 
 
 		 282 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  58.62 
 
 		 332 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 238 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  61.63 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  48.65 
 
 		 258 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  57.32 
 
 		 333 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  57.32 
 
 		 333 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 339 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>