More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0121 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  99.08 
 
 		 437 aa  866    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  876    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  77.33 
 
 		 436 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  77.51 
 
 		 436 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  77.33 
 
 		 436 aa  678    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  67.73 
 
 		 424 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  68.7 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  65.52 
 
 		 441 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  67.65 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  66.01 
 
 		 432 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  66.01 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  63.08 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  64.15 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  62.14 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  63.33 
 
 		 437 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  66.83 
 
 		 439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  65.14 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  61.22 
 
 		 429 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  64.41 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  60.64 
 
 		 430 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  65.29 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  61.34 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  58.37 
 
 		 447 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  67.33 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  60.24 
 
 		 441 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  58.29 
 
 		 438 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  59.76 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  59.76 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  57.88 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  53.12 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  55.04 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  60.2 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  54.93 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  53.27 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  53.27 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  55.17 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  53.3 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  51.69 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  51.69 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  59.04 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  53.33 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  55.75 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  54.68 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  55.99 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  55.99 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  50.61 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 429 aa  352  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  47.3 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 422 aa  312  5.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 421 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  38.35 
 
 		 438 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  31.78 
 
 		 430 aa  173  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  27.29 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  31.05 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  30.92 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  30.64 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 436 aa  146  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  30.35 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  30.35 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  30.35 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  30.06 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  30 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.04 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  30 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  30.06 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.41 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 421 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  28.23 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  28.33 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.58 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 407 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  27.75 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.75 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.75 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  27.75 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.75 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>