275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0099 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  65.51 
 
 
604 aa  844  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  92.7 
 
 
611 aa  1081  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  65.42 
 
 
613 aa  802  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  100 
 
 
605 aa  1242  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  60.98 
 
 
616 aa  754  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  87.44 
 
 
613 aa  1099  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  63.71 
 
 
601 aa  817  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  45.22 
 
 
600 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  45.22 
 
 
600 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  46.52 
 
 
600 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  47.29 
 
 
600 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5444  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.61 
 
 
599 aa  508  1e-142  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  46.56 
 
 
601 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  46.69 
 
 
600 aa  505  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0344  Pyrrolo-quinoline quinone  43.43 
 
 
623 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.122301  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  45.64 
 
 
601 aa  493  1e-138  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  44.18 
 
 
608 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2145  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.28 
 
 
601 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.885263  normal  0.307838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1809  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  46.28 
 
 
601 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  45.38 
 
 
601 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1781  Pyrrolo-quinoline quinone  45.04 
 
 
601 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981644  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0421  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  46.28 
 
 
590 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2790  Pyrrolo-quinoline quinone  41.78 
 
 
615 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5977  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  45.18 
 
 
600 aa  485  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.391325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1761  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  45.39 
 
 
601 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1717  Pyrrolo-quinoline quinone  42.28 
 
 
620 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  5.84084e-08  unclonable  4.29175e-07 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  42.28 
 
 
605 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4686  Pyrrolo-quinoline quinone  45.21 
 
 
607 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.829526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  44.86 
 
 
592 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  43.69 
 
 
601 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  45.57 
 
 
588 aa  482  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  43.86 
 
 
608 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  43.4 
 
 
606 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5752  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  44.13 
 
 
599 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0649397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0508  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  44.86 
 
 
601 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.619983  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  45 
 
 
629 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4632  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  44.27 
 
 
626 aa  470  1e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4518  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  44.21 
 
 
626 aa  468  1e-130  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.966685  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4210  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  42.16 
 
 
627 aa  466  1e-130  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719388  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4150  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  44.21 
 
 
626 aa  468  1e-130  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383489  normal  0.812853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1907  Pyrrolo-quinoline quinone  43.4 
 
 
624 aa  466  1e-130  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135977  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0471  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  42.03 
 
 
625 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2993  Pyrrolo-quinoline quinone  43.35 
 
 
632 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.391865  normal  0.445791 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3393  putative methanol dehydrogenase protein, large subunit  42.36 
 
 
606 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.078697  normal  0.0119159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2260  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  43.72 
 
 
601 aa  459  1e-128  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  42.65 
 
 
620 aa  461  1e-128  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  44.37 
 
 
619 aa  462  1e-128  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  41.18 
 
 
606 aa  453  1e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2314  Pyrrolo-quinoline quinone  42.9 
 
 
625 aa  454  1e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.00555e-06  unclonable  3.20672e-07 
 
 
 
NC_007947  Mfla_2044  Pyrrolo-quinoline quinone  40.41 
 
 
599 aa  428  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.115508  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3149  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  41.27 
 
 
631 aa  428  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  37.43 
 
 
580 aa  348  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  38.27 
 
 
579 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.68 
 
 
587 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.68 
 
 
587 aa  340  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.68 
 
 
587 aa  340  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  38.81 
 
 
554 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.42 
 
 
584 aa  334  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  38.65 
 
 
602 aa  333  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.42 
 
 
584 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.34 
 
 
589 aa  331  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  38.45 
 
 
579 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  37.84 
 
 
588 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  39.54 
 
 
602 aa  329  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  38.78 
 
 
597 aa  327  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1887  quinoprotein alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
587 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  36.57 
 
 
580 aa  324  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1963  Pyrrolo-quinoline quinone  37.37 
 
 
591 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0160229  normal  0.256272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  37.45 
 
 
724 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1855  Pyrrolo-quinoline quinone  36 
 
 
587 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.668201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1023  Pyrrolo-quinoline quinone  38.74 
 
 
593 aa  322  1e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  36.85 
 
 
726 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  36.97 
 
 
718 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  36.43 
 
 
697 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  36.78 
 
 
582 aa  316  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  34.38 
 
 
595 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.38 
 
 
595 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  35.11 
 
 
706 aa  315  1e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  34.38 
 
 
595 aa  315  1e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.42 
 
 
726 aa  314  3e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  35.12 
 
 
570 aa  314  4e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  36.28 
 
 
709 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  37.06 
 
 
730 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  34.74 
 
 
572 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0726  Pyrrolo-quinoline quinone  37.93 
 
 
549 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0623502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.77 
 
 
566 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  34.7 
 
 
720 aa  310  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  35.71 
 
 
575 aa  310  6e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  36.62 
 
 
721 aa  309  7e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  34.88 
 
 
718 aa  309  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.71 
 
 
575 aa  309  1e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.81 
 
 
707 aa  308  2e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  36.36 
 
 
705 aa  307  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  35.11 
 
 
575 aa  307  4e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  34 
 
 
575 aa  305  1e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  36.43 
 
 
698 aa  305  1e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2673  quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  35.05 
 
 
588 aa  305  1e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0513715  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  35.48 
 
 
702 aa  305  2e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
712 aa  305  2e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  33.1 
 
 
573 aa  303  7e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>