116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0094 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0094  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2349  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  84.33 
 
 
213 aa  361  5e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2989  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  80.09 
 
 
212 aa  328  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6356  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  56.28 
 
 
198 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5828  cytochrome c oxidase subunit III  50.25 
 
 
200 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0695  putative cytochrome c oxidase subunit I  53.5 
 
 
201 aa  198  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  51.79 
 
 
874 aa  189  3e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5242  cytochrome c oxidase subunit III  47.74 
 
 
200 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.645563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  49.75 
 
 
877 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1447  cytochrome c oxidase, subunit III  36.27 
 
 
203 aa  124  8e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.703222  normal  0.345478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2028  cytochrome c oxidase subunit III  27.41 
 
 
214 aa  72.4  5e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  2.42871e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2185  putative cytochrome c oxidase, subunit III  26.87 
 
 
217 aa  67  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0357507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  26.51 
 
 
879 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  26.51 
 
 
879 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  27.32 
 
 
962 aa  63.2  3e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  27.32 
 
 
974 aa  63.2  3e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  27.32 
 
 
950 aa  62.4  4e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0081  putative cytochrome c oxidase subunit III  27.23 
 
 
217 aa  62.4  5e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379927  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  26.53 
 
 
882 aa  62  6e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0458  putative cytochrome c oxidase subunit I  27.32 
 
 
201 aa  58.9  6e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5489  cytochrome c oxidase subunit III  26.18 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324839  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  27.91 
 
 
818 aa  56.6  3e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  26.53 
 
 
879 aa  56.2  4e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  24.72 
 
 
198 aa  55.8  5e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  23.3 
 
 
197 aa  53.9  2e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  26.4 
 
 
208 aa  53.9  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  28.09 
 
 
197 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  30.87 
 
 
293 aa  53.1  3e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  22.86 
 
 
210 aa  53.1  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  28.19 
 
 
293 aa  53.1  3e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  27.81 
 
 
876 aa  52.8  4e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  23.86 
 
 
201 aa  52.4  5e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  29.56 
 
 
294 aa  52.4  5e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 
206 aa  52.4  5e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  28.86 
 
 
294 aa  51.6  1e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  23.86 
 
 
201 aa  51.6  1e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  21.47 
 
 
211 aa  50.8  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  28.4 
 
 
286 aa  50.8  1e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  27.53 
 
 
197 aa  50.1  2e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  27.53 
 
 
197 aa  50.1  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  24.44 
 
 
208 aa  50.1  2e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  27.53 
 
 
197 aa  50.1  2e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  26.88 
 
 
283 aa  50.1  2e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  30.92 
 
 
293 aa  49.7  3e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  26.63 
 
 
796 aa  50.1  3e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  27.74 
 
 
286 aa  49.7  3e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  26.04 
 
 
222 aa  49.7  4e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 
285 aa  49.3  4e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  29.45 
 
 
285 aa  49.3  4e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 
285 aa  49.3  4e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  25.27 
 
 
200 aa  49.7  4e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  24.51 
 
 
214 aa  49.7  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  26.97 
 
 
197 aa  48.9  6e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  29.75 
 
 
293 aa  48.9  6e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  28.47 
 
 
286 aa  48.5  8e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  24.29 
 
 
206 aa  48.1  9e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  29.93 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  29.45 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  29.45 
 
 
285 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  26.85 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  23.16 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  26.85 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  28.36 
 
 
286 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  27.17 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  27.27 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  26.17 
 
 
293 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  27.17 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  26.78 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  28.57 
 
 
293 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  26.14 
 
 
293 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  28.47 
 
 
291 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  26.28 
 
 
286 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  29.2 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  23.56 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  26.03 
 
 
284 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  26.28 
 
 
286 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  29.2 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  29.2 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  29.2 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  29.2 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  29.2 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  27.17 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  24.18 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  28.1 
 
 
293 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  24.35 
 
 
806 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  28.77 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  29.2 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  28.08 
 
 
285 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  28.77 
 
 
285 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  27.61 
 
 
298 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  28.08 
 
 
285 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  26.43 
 
 
288 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  22.56 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  26.23 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  24.18 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  25.54 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  28.77 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  24.73 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  22.22 
 
 
200 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>