19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0085 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0078  hypothetical protein  90.96 
 
 		 399 aa  692    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  779    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.56108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0167  hypothetical protein  96.11 
 
 		 387 aa  727    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5541  hypothetical protein  49.33 
 
 		 378 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1614  hypothetical protein  34.29 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0225237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.652792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1300  hypothetical protein  33.68 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061722  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6764  hypothetical protein  30.53 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167002 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4319  hypothetical protein  30.54 
 
 		 584 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0076  hypothetical protein  27.32 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01110  hypothetical protein  32.14 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2859  hypothetical protein  36.36 
 
 		 317 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0296  hypothetical protein  34.27 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1263  hypothetical protein  31.43 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4379  hypothetical protein  39.22 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01487  hypothetical protein  29.11 
 
 		 355 aa  46.2  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0296  hypothetical protein  34.48 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0285  hypothetical protein  34.48 
 
 		 353 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.488239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>