47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0080 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0080  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  264  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0162  hypothetical protein  89.09 
 
 
121 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1475  hypothetical protein  51.35 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2122  hypothetical protein  53.33 
 
 
123 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1274  putative transposon  50.89 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31230  hypothetical protein  52.25 
 
 
175 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000641802  unclonable  1.55201e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3815  hypothetical protein  52.78 
 
 
123 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0782579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7395  hypothetical protein  49.57 
 
 
123 aa  103  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1543  hypothetical protein  45.45 
 
 
131 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0356843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0470  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0677  hypothetical protein  49.55 
 
 
116 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.759632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2608  hypothetical protein  48.65 
 
 
116 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3038  hypothetical protein  48.65 
 
 
116 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3536  hypothetical protein  48.65 
 
 
116 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0599  hypothetical protein  50.44 
 
 
115 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2081  hypothetical protein  50.44 
 
 
113 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2738  hypothetical protein  47.75 
 
 
116 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.460975  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7704  hypothetical protein  51.43 
 
 
123 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0707762 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2521  hypothetical protein  51.85 
 
 
203 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124259  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2010  hypothetical protein  44.96 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636373  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2663  hypothetical protein  43.61 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.996553  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3668  hypothetical protein  45.95 
 
 
118 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3150  hypothetical protein  43.9 
 
 
131 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4163  putative lipoprotein  43.75 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1501  putative lipoprotein  46.43 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0353  hypothetical protein  40.5 
 
 
128 aa  86.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239332  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0794  hypothetical protein  44.21 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.544524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3529  putative lipoprotein  39.47 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.348818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1041  hypothetical protein  49.02 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2083  putative lipoprotein  38.74 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36010  lipoprotein  37.39 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0683  putative lipoprotein  38.05 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1875  putative lipoprotein  40.71 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2936  putative lipoprotein  38.39 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377155  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1285  putative lipoprotein  38.94 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2617  putative lipoprotein  37.5 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143541  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0460  putative lipoprotein  38.39 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552227  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1259  putative lipoprotein  38.74 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1250  hypothetical protein  40.35 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2650  putative lipoprotein  41.44 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290276  normal  0.134828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2609  lipoprotein  39.33 
 
 
197 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.707585  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3027  hypothetical protein  35.65 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2728  putative lipoprotein  35.65 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31150  hypothetical protein  35.78 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000059754  unclonable  1.00757e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2326  putative lipoprotein  37.17 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1482  hypothetical protein  37.5 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3735  hypothetical protein  37.08 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>