20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0078 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0078  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5877  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3879  hypothetical protein  55 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3589  hypothetical protein  55 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3013  hypothetical protein  54.67 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0072  hypothetical protein  46.75 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5177  hypothetical protein  48.05 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3831  hypothetical protein  38.67 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3377  hypothetical protein  39.13 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7016  hypothetical protein  36.11 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0174  hypothetical protein  38.67 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0787  hypothetical protein  42.62 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.18503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2687  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1657  hypothetical protein  32.43 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.428098  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3600  hypothetical protein  30.26 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1861  hypothetical protein  33.78 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.319136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1582  hypothetical protein  33.78 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.13435 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.726061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1879  hypothetical protein  34.67 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>