18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0076 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  95.35 
 
 
85 aa  161  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  80.72 
 
 
86 aa  133  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  78.31 
 
 
86 aa  132  1e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  43.53 
 
 
82 aa  72  3e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3378  hypothetical protein  58.62 
 
 
71 aa  59.7  1e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0790  hypothetical protein  38.27 
 
 
78 aa  51.6  3e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5763  hypothetical protein  34.52 
 
 
79 aa  49.7  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5711  hypothetical protein  33.75 
 
 
133 aa  48.9  2e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6917  hypothetical protein  41.46 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  38.75 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  35.8 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  35 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6299  hypothetical protein  36.25 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  33.75 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  33.75 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4743  hypothetical protein  34.57 
 
 
78 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.990043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>