17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0072 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0072  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5877  hypothetical protein  58.97 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3879  hypothetical protein  47.44 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3589  hypothetical protein  47.44 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0078  hypothetical protein  46.75 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3013  hypothetical protein  47.44 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5177  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2687  hypothetical protein  38.46 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2945  hypothetical protein  37.18 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3831  hypothetical protein  35.9 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0787  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.18503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7016  hypothetical protein  38.89 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3600  hypothetical protein  36 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1879  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1921  hypothetical protein  40.98 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3377  hypothetical protein  35.29 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0174  hypothetical protein  39.19 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>