14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0064 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.980549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3371  hypothetical protein  92.93 
 
 		 103 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2340  hypothetical protein  67.68 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3779  hypothetical protein  65.66 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2209  hypothetical protein  56 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3299  hypothetical protein  53 
 
 		 102 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0948  hypothetical protein  53 
 
 		 102 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00452542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1667  hypothetical protein  51 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3204  hypothetical protein  52 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1199  hypothetical protein  52.63 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5229  hypothetical protein  46.46 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226919  normal  0.25311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1335  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1731  Inorganic pyrophosphatase  41.41 
 
 		 266 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  hitchhiker  0.00351022 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5594  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.376918  hitchhiker  0.00887445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>