More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0062 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
203 aa  420  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  67.17 
 
 
204 aa  295  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  66.16 
 
 
204 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  64.68 
 
 
208 aa  283  2e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  60.4 
 
 
203 aa  271  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  60.4 
 
 
203 aa  271  5e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  56.93 
 
 
203 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  59.6 
 
 
208 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  66.11 
 
 
181 aa  248  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  53.27 
 
 
203 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  50.82 
 
 
192 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  50.82 
 
 
194 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  47.03 
 
 
203 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 
194 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  50.76 
 
 
202 aa  199  2e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  48.91 
 
 
192 aa  195  4e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 
171 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  40.43 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
180 aa  75.5  5e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  31.18 
 
 
215 aa  69.3  4e-11  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  33.76 
 
 
227 aa  67  2e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 
172 aa  66.2  3e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 
246 aa  65.5  5e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.14 
 
 
180 aa  64.3  1e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.35 
 
 
224 aa  62.4  5e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
177 aa  60.8  1e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
222 aa  60.8  1e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  45.45 
 
 
182 aa  60.5  2e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40.74 
 
 
183 aa  59.3  3e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  39.74 
 
 
192 aa  59.3  4e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
209 aa  58.5  7e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
186 aa  58.2  7e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  26.38 
 
 
204 aa  58.5  7e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
186 aa  58.2  7e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 
226 aa  58.2  7e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3373  hypothetical protein  76.47 
 
 
84 aa  58.2  8e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174748  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 
198 aa  57.4  1e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 
226 aa  57.4  1e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  38.71 
 
 
226 aa  57.8  1e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  37.14 
 
 
182 aa  57  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
225 aa  56.6  2e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  45.31 
 
 
195 aa  57  2e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  35.71 
 
 
182 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  35.71 
 
 
182 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.97737e-12 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  31.82 
 
 
190 aa  56.2  3e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
239 aa  56.2  4e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  36.11 
 
 
227 aa  55.8  4e-07  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
239 aa  55.8  4e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 
184 aa  55.5  5e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  35.71 
 
 
102 aa  55.5  5e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  35.71 
 
 
182 aa  55.5  5e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
239 aa  55.8  5e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  35.71 
 
 
182 aa  55.5  5e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 
187 aa  55.1  6e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  35.71 
 
 
182 aa  55.5  6e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 
209 aa  55.5  6e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
218 aa  55.5  6e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.29 
 
 
186 aa  55.1  7e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.29 
 
 
186 aa  55.1  7e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  38.27 
 
 
198 aa  55.1  7e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 
233 aa  55.1  7e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
182 aa  55.1  7e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  53.85 
 
 
185 aa  54.7  8e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  39.73 
 
 
237 aa  55.1  8e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  38.96 
 
 
231 aa  54.7  9e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  24.71 
 
 
189 aa  54.7  9e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  27.59 
 
 
193 aa  54.7  9e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  27.59 
 
 
193 aa  54.7  9e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  27.59 
 
 
193 aa  54.7  9e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  26.61 
 
 
240 aa  54.7  9e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 
184 aa  53.9  1e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 
212 aa  54.3  1e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  34.94 
 
 
231 aa  54.3  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 
234 aa  53.9  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 
204 aa  53.5  2e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  34.31 
 
 
228 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 
226 aa  53.5  2e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
230 aa  53.9  2e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
183 aa  53.5  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
215 aa  53.1  3e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 
207 aa  52.8  3e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
215 aa  52.8  3e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  36.59 
 
 
230 aa  53.1  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  35.71 
 
 
182 aa  53.1  3e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
188 aa  52.8  3e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  32.29 
 
 
227 aa  53.1  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  48.61 
 
 
195 aa  53.1  3e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 
208 aa  53.1  3e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  53.1  3e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
215 aa  53.1  3e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 
218 aa  52.8  3e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  33 
 
 
188 aa  53.1  3e-06  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 
194 aa  52.4  4e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 
194 aa  52.4  4e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 
223 aa  52.4  4e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
190 aa  52.4  4e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  52.4  4e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
233 aa  52.8  4e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
241 aa  52.4  4e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  39.24 
 
 
281 aa  52.8  4e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>