More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0059 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0059  inositol monophosphatase  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0440  inositol monophosphatase  39.46 
 
 
270 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2434  inositol monophosphatase  38.19 
 
 
268 aa  179  5e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0369  inositol monophosphatase  37.74 
 
 
270 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1331  inositol monophosphatase  34.9 
 
 
264 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  0.102778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3122  inositol monophosphatase  33.59 
 
 
276 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.537848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2683  inositol-phosphate phosphatase  33.2 
 
 
266 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169796  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1944  inositol monophosphatase  33.97 
 
 
275 aa  134  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0143243  normal  0.761582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0480  inositol monophosphatase  35.74 
 
 
285 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  decreased coverage  0.000552939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1995  inositol monophosphatase  32.4 
 
 
269 aa  131  1e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3111  inositol monophosphatase  30.8 
 
 
269 aa  130  2e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  hitchhiker  0.000300564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2153  inositol monophosphatase  31.91 
 
 
275 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.945821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1934  inositol monophosphatase family protein  29.96 
 
 
273 aa  125  8e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1760  inositol monophosphatase  31.84 
 
 
277 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.538338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1943  inositol monophosphatase  31.78 
 
 
274 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910476  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27030  Inositol monophosphatase  30.98 
 
 
274 aa  121  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2152  inositol monophosphatase  31.4 
 
 
274 aa  118  8e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1687  inositol monophosphatase  32.81 
 
 
272 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1933  inositol monophosphatase family protein  29.89 
 
 
278 aa  114  2e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1511  inositol monophosphatase  28.85 
 
 
274 aa  112  8e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2393  inositol monophosphatase  29.17 
 
 
275 aa  108  7e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0825  inositol monophosphatase family protein  31.06 
 
 
275 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0832  inositol monophosphatase family protein  31.49 
 
 
275 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7112  inositol monophosphatase  31.54 
 
 
273 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0508739  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2346  inositol monophosphatase  28.35 
 
 
276 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.960977  normal  0.160347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3188  inositol monophosphatase  27.49 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  1.02923e-06  hitchhiker  6.834e-10 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  31.67 
 
 
267 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1437  inositol monophosphatase  30.28 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224177  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  31.39 
 
 
263 aa  96.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3030  inositol monophosphatase  26.12 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0638536  normal  0.49739 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  31.39 
 
 
266 aa  95.9  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2855  Inositol-phosphate phosphatase  28.68 
 
 
275 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3254  inositol monophosphatase family protein  28.68 
 
 
275 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  29.49 
 
 
262 aa  92.8  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  31.5 
 
 
271 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3034  inositol monophosphatase  30.26 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  29.78 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  31.43 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1499  inositol monophosphatase  31.2 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  29.06 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0967  Inositol-phosphate phosphatase  31.46 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  31.14 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  30.92 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0274  inositol monophosphate family protein  29.07 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  30.08 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  31.03 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  29.96 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  30.08 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  8.05299e-09 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1241  inositol monophosphatase  29.39 
 
 
267 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.921359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  30.57 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1101  inositol monophosphatase  29.82 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6007  inositol-phosphate phosphatase  31.27 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  31.53 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  31.53 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  31.53 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  31.53 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  30.54 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.55872e-06  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  28.51 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.25107e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  26.39 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  31.53 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  31.88 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  28.51 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  3.01386e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  28.51 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.42854e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  26.39 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01052  hypothetical protein  27.56 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18323  predicted protein  30.83 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  31.53 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  31.53 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.52035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  32.51 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0612  Inositol-phosphate phosphatase  30.74 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0601  inositol-phosphate phosphatase  30.74 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.406636  normal  0.0239837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  29.66 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  29.66 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  28.31 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.20191e-08 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0377  inositol monophosphatase  28.17 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  28.07 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  29.05 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  29.56 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2660  inositol-phosphate phosphatase  29.27 
 
 
263 aa  84.7  1e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.57513e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  27.23 
 
 
267 aa  84.7  1e-15  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  33.67 
 
 
270 aa  85.1  1e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  33.67 
 
 
270 aa  85.1  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2754  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  85.5  1e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00416326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  30.2 
 
 
270 aa  84.3  2e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004363  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  28.19 
 
 
267 aa  84  2e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.12516e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  84.3  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  84.3  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0576  Inositol-phosphate phosphatase  30.35 
 
 
264 aa  84.3  2e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587909  hitchhiker  0.0082747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0673  Inositol-phosphate phosphatase  32.05 
 
 
274 aa  84  2e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  28.07 
 
 
267 aa  84.3  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  30.04 
 
 
271 aa  83.6  3e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>