More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0053 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  98.5 
 
 
402 aa  796  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  100 
 
 
402 aa  807  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  76.12 
 
 
401 aa  601  1e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  71.64 
 
 
400 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  59.65 
 
 
403 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  59.85 
 
 
394 aa  461  1e-128  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  55.84 
 
 
398 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  56.27 
 
 
396 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  54.59 
 
 
392 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  55.09 
 
 
1305 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  54.59 
 
 
392 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  54.24 
 
 
390 aa  388  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  54.52 
 
 
393 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  52.88 
 
 
411 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  50.51 
 
 
400 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  48.87 
 
 
403 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  47.06 
 
 
408 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  54.62 
 
 
1230 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  48.21 
 
 
402 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  52.94 
 
 
389 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  50.38 
 
 
393 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  50.39 
 
 
394 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  53.32 
 
 
398 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  52.04 
 
 
401 aa  362  7e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  54.59 
 
 
1228 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  48.27 
 
 
405 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  50.77 
 
 
391 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  47.45 
 
 
396 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  49.87 
 
 
399 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  52.44 
 
 
389 aa  358  1e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  51.64 
 
 
402 aa  357  3e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  52.03 
 
 
382 aa  356  4e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  50 
 
 
397 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  46.7 
 
 
391 aa  356  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  47.36 
 
 
400 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  54.62 
 
 
1230 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  48.64 
 
 
404 aa  353  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  52.3 
 
 
400 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  49.23 
 
 
404 aa  352  9e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  47.74 
 
 
405 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  51.15 
 
 
389 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  51.02 
 
 
416 aa  342  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  47.24 
 
 
405 aa  339  7e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  50 
 
 
398 aa  337  2e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  51.39 
 
 
402 aa  336  4e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  51.39 
 
 
402 aa  336  4e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  47.94 
 
 
393 aa  335  6e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  46.35 
 
 
390 aa  335  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  47.1 
 
 
400 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  47.9 
 
 
394 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  51.43 
 
 
385 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  50.38 
 
 
404 aa  332  7e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  46.52 
 
 
407 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  50.39 
 
 
396 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  50.39 
 
 
396 aa  328  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  48.21 
 
 
392 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  48.21 
 
 
392 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  47.96 
 
 
392 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  47.96 
 
 
392 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  49.87 
 
 
371 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  47.96 
 
 
392 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  47.96 
 
 
392 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  48.34 
 
 
395 aa  321  1e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  49.37 
 
 
371 aa  320  2e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  47.21 
 
 
392 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  46.53 
 
 
393 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  46.53 
 
 
393 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  43.58 
 
 
372 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  48.84 
 
 
396 aa  315  1e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  46.72 
 
 
391 aa  314  2e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  48.1 
 
 
392 aa  312  7e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  42.82 
 
 
372 aa  310  3e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  48.22 
 
 
413 aa  309  6e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  42.13 
 
 
408 aa  308  1e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  43.84 
 
 
401 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  46.06 
 
 
407 aa  306  4e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  44.86 
 
 
402 aa  306  5e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  44.58 
 
 
397 aa  303  2e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  48.48 
 
 
410 aa  303  3e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  47.52 
 
 
399 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  48.21 
 
 
399 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  46.43 
 
 
397 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  43.78 
 
 
412 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  44.39 
 
 
401 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  36.36 
 
 
397 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.19259e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  37.94 
 
 
398 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.54307e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  42.6 
 
 
396 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  42.29 
 
 
589 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  36.39 
 
 
404 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  46 
 
 
367 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  45.62 
 
 
392 aa  274  2e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  42.64 
 
 
412 aa  274  2e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  36.92 
 
 
401 aa  273  3e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  37.25 
 
 
399 aa  272  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.13101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  37.78 
 
 
394 aa  272  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  39.56 
 
 
404 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  35.57 
 
 
398 aa  270  3e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  38.14 
 
 
412 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  38.07 
 
 
398 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  41.37 
 
 
422 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>