155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0040 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  47.41 
 
 
803 aa  793  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  61.29 
 
 
797 aa  1030  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  69.2 
 
 
811 aa  1163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  71.08 
 
 
791 aa  1187  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  49.81 
 
 
825 aa  817  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  71.13 
 
 
783 aa  1161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  47.77 
 
 
793 aa  804  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  72.27 
 
 
795 aa  1213  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  62.85 
 
 
1230 aa  1030  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  60.69 
 
 
815 aa  1014  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  70.44 
 
 
796 aa  1178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  67.39 
 
 
794 aa  1136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  55.34 
 
 
792 aa  906  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  56.66 
 
 
835 aa  946  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  65.43 
 
 
802 aa  1106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  60.53 
 
 
794 aa  1003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  67.23 
 
 
795 aa  1123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  63.58 
 
 
832 aa  1037  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  76.74 
 
 
790 aa  1303  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  67.25 
 
 
797 aa  1134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  65.85 
 
 
795 aa  1112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  63.14 
 
 
1305 aa  1033  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  41.02 
 
 
788 aa  638  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  71.87 
 
 
798 aa  1206  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  69.82 
 
 
802 aa  1128  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  53.26 
 
 
811 aa  829  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  67.79 
 
 
800 aa  1122  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  100 
 
 
811 aa  1689  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  68.61 
 
 
811 aa  1155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  66.32 
 
 
851 aa  1068  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  67.82 
 
 
860 aa  1112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1282  putative phosphoketolase  40.77 
 
 
788 aa  637  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0002253  normal  0.0247047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  65.78 
 
 
802 aa  1102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  68.61 
 
 
811 aa  1154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  99.63 
 
 
811 aa  1686  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1358  putative phosphoketolase  75.16 
 
 
797 aa  1253  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1589  putative phosphoketolase  66.28 
 
 
810 aa  1106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1219  putative phosphoketolase  52.85 
 
 
823 aa  867  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.514131  normal  0.618192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1271  Phosphoketolase  69.88 
 
 
792 aa  1127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1069  Phosphoketolase  66.32 
 
 
783 aa  1103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00313682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28490  phosphoketolase  68.88 
 
 
837 aa  1152  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0694  Fructose-6-phosphate phosphoketolase  67.47 
 
 
828 aa  1103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5418  Phosphoketolase  68 
 
 
771 aa  1083  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308896  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0625  D-xylulose 5-phosphate/D-fructose 6-phosphate phosphoketolase  50.87 
 
 
831 aa  835  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4985  Phosphoketolase  55.57 
 
 
784 aa  855  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3237  Phosphoketolase  68.43 
 
 
798 aa  1158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0305245  normal  0.0217668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2576  Phosphoketolase  66.96 
 
 
848 aa  1072  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.74069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3504  phosphoketolase  67.31 
 
 
772 aa  1088  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705245  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2196  Phosphoketolase  66.88 
 
 
782 aa  1088  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118493  hitchhiker  0.000352137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22210  putative phosphoketolase  65.84 
 
 
823 aa  1093  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02820  putative phosphoketolase  63.67 
 
 
820 aa  1026  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1694  putative phosphoketolase  65.43 
 
 
802 aa  1104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  60.69 
 
 
815 aa  1014  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  61.46 
 
 
813 aa  1048  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  65.22 
 
 
821 aa  1096  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  60.73 
 
 
820 aa  1013  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  62.6 
 
 
1230 aa  1027  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  65.38 
 
 
833 aa  1075  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  65.51 
 
 
832 aa  1080  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  68.8 
 
 
824 aa  1123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  70.66 
 
 
783 aa  1142  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  67.82 
 
 
794 aa  1145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  68.25 
 
 
789 aa  1134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  48.23 
 
 
782 aa  743  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  69.97 
 
 
800 aa  1182  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6387  putative phosphoketolase  59.95 
 
 
787 aa  979  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1827  phosphoketolase  73.58 
 
 
793 aa  1257  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  61.76 
 
 
791 aa  1014  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  68.7 
 
 
802 aa  1155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  65.69 
 
 
791 aa  1085  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  71.59 
 
 
809 aa  1211  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  70.23 
 
 
788 aa  1130  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  49.81 
 
 
794 aa  792  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  43.74 
 
 
817 aa  690  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  74.77 
 
 
804 aa  1243  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  48.1 
 
 
818 aa  797  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.40609e-05 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  49.24 
 
 
788 aa  796  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  44.73 
 
 
813 aa  705  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  65.22 
 
 
796 aa  1058  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  71.63 
 
 
807 aa  1216  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  62.98 
 
 
1228 aa  1027  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  70.08 
 
 
793 aa  1191  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  68.38 
 
 
806 aa  1136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  70.38 
 
 
784 aa  1120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  41.53 
 
 
788 aa  644  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  60.4 
 
 
797 aa  1006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  65.69 
 
 
791 aa  1085  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  70.36 
 
 
784 aa  1129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  70.89 
 
 
784 aa  1109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  71.7 
 
 
802 aa  1153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  62.34 
 
 
811 aa  1043  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  75.42 
 
 
793 aa  1266  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  69.91 
 
 
797 aa  1130  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  66.71 
 
 
823 aa  1131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  68.56 
 
 
800 aa  1118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3542  putative phosphoketolase  40.63 
 
 
788 aa  636  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  67.87 
 
 
789 aa  1140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  47.27 
 
 
792 aa  762  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  63.51 
 
 
811 aa  1044  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  41.38 
 
 
788 aa  636  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>