More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0039 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  100 
 
 
242 aa  468  1e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  98.35 
 
 
242 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  72.29 
 
 
248 aa  328  5e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  74.03 
 
 
248 aa  327  1e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  73.71 
 
 
248 aa  291  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.26 
 
 
242 aa  238  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  58.9 
 
 
246 aa  231  8e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.41 
 
 
245 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.62 
 
 
268 aa  215  6e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.29 
 
 
223 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  38.12 
 
 
219 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35 
 
 
250 aa  115  7e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  34.26 
 
 
215 aa  113  2e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1156  HAD family hydrolase  37.11 
 
 
226 aa  112  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0666674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  32.46 
 
 
214 aa  111  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.48 
 
 
258 aa  110  2e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  36.53 
 
 
456 aa  110  2e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.52801e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  37.78 
 
 
456 aa  110  2e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  35.78 
 
 
207 aa  108  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  34.84 
 
 
216 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  38.22 
 
 
456 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.29 
 
 
313 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.35 
 
 
257 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  36.56 
 
 
219 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.93 
 
 
262 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.91 
 
 
252 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.34 
 
 
243 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.91 
 
 
250 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.37 
 
 
1051 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.08 
 
 
1314 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.47 
 
 
260 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  38.33 
 
 
218 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.32741e-07  hitchhiker  4.51899e-07 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.16 
 
 
231 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.06 
 
 
1050 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.56 
 
 
1055 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  33.94 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.6 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  36.2 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.54 
 
 
1053 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.48 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.29 
 
 
525 aa  98.6  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.42 
 
 
1052 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.19 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.19 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.19 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.19 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  34.18 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.88 
 
 
1051 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  35.87 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.19 
 
 
253 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.84 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.72 
 
 
1053 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.03 
 
 
244 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.2 
 
 
1053 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  37.44 
 
 
986 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  31.34 
 
 
227 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.49 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  31.96 
 
 
220 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.93 
 
 
268 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.97 
 
 
396 aa  92  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.21 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  33.85 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  37.78 
 
 
978 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
228 aa  88.6  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  32.99 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.19 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.04 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  33.33 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.47 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  34.74 
 
 
208 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.39 
 
 
248 aa  84.3  1e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  30.23 
 
 
221 aa  84.7  1e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.11 
 
 
202 aa  84  2e-15  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  29.47 
 
 
221 aa  83.6  2e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  36.6 
 
 
227 aa  84.3  2e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  33.18 
 
 
219 aa  84  2e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.91 
 
 
252 aa  84  2e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  35.68 
 
 
219 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  35.68 
 
 
219 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  35.68 
 
 
219 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  31.34 
 
 
222 aa  83.2  4e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.91 
 
 
217 aa  82.8  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
220 aa  82.8  4e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  34.85 
 
 
235 aa  82.8  5e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  35.68 
 
 
219 aa  82.8  5e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  32.29 
 
 
233 aa  82.4  6e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.78 
 
 
221 aa  82  7e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  31.63 
 
 
230 aa  82  8e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.63 
 
 
1088 aa  82  8e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
216 aa  82  9e-15  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
242 aa  81.6  9e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  30.67 
 
 
214 aa  81.6  1e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
216 aa  81.6  1e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  35.18 
 
 
219 aa  81.3  1e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  30.88 
 
 
222 aa  80.9  2e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 
217 aa  80.9  2e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  35.18 
 
 
219 aa  80.1  3e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>