128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0038 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  99.08 
 
 
761 aa  1511  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 
761 aa  1520  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  51.14 
 
 
760 aa  697  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  52.48 
 
 
762 aa  724  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  50.33 
 
 
777 aa  681  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  33.86 
 
 
780 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  32.6 
 
 
775 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  33.16 
 
 
755 aa  422  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  37.16 
 
 
978 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 
759 aa  400  1e-110  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  36.27 
 
 
748 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  34.79 
 
 
965 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  33.06 
 
 
789 aa  376  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  32.43 
 
 
787 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  31.1 
 
 
778 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  5.28962e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  32.04 
 
 
787 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  40.65 
 
 
763 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  36.11 
 
 
720 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  1.28676e-06 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  32.18 
 
 
781 aa  358  2e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  32.62 
 
 
807 aa  349  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  30.82 
 
 
794 aa  342  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  28.24 
 
 
780 aa  333  8e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  33.52 
 
 
776 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  27.95 
 
 
781 aa  323  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.03 
 
 
749 aa  322  2e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  32.7 
 
 
755 aa  318  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  32.7 
 
 
755 aa  318  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  32.48 
 
 
755 aa  317  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  32.47 
 
 
755 aa  317  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  32.92 
 
 
755 aa  316  8e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  32.92 
 
 
755 aa  316  8e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  28.24 
 
 
769 aa  317  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  32.29 
 
 
755 aa  316  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  32.92 
 
 
755 aa  316  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.14 
 
 
759 aa  315  2e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  30.44 
 
 
790 aa  314  5e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  31.95 
 
 
757 aa  312  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  30.4 
 
 
790 aa  310  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  39.88 
 
 
704 aa  299  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  28.7 
 
 
825 aa  297  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  29.96 
 
 
795 aa  293  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  32.94 
 
 
780 aa  291  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.81 
 
 
1051 aa  290  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  29.2 
 
 
795 aa  287  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 
804 aa  288  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  28.82 
 
 
858 aa  287  6e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  28.8 
 
 
795 aa  283  7e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.03 
 
 
1050 aa  281  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  26.35 
 
 
780 aa  274  4e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  31.64 
 
 
791 aa  274  5e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  31.5 
 
 
807 aa  274  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.91 
 
 
810 aa  273  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  31.66 
 
 
767 aa  272  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.41 
 
 
1053 aa  270  6e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.99 
 
 
1055 aa  270  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  30.24 
 
 
800 aa  268  3e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.41 
 
 
1051 aa  267  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  32.27 
 
 
784 aa  267  6e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  30.14 
 
 
848 aa  267  6e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32 
 
 
1053 aa  267  6e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  27.77 
 
 
834 aa  267  6e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.08 
 
 
1052 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  30.78 
 
 
791 aa  264  5e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29.49 
 
 
843 aa  262  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.53 
 
 
786 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  30.14 
 
 
784 aa  261  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.48 
 
 
777 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  26.59 
 
 
789 aa  259  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  31.08 
 
 
794 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  30.53 
 
 
753 aa  256  1e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  29.65 
 
 
824 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.36 
 
 
794 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.23 
 
 
787 aa  253  8e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  28.15 
 
 
774 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  26.65 
 
 
768 aa  251  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  28.24 
 
 
771 aa  250  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  29.96 
 
 
790 aa  250  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  30.72 
 
 
786 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  32.91 
 
 
748 aa  248  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  29.23 
 
 
786 aa  244  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0483  trehalose and maltose hydrolase ( phosphorylase)  28.07 
 
 
769 aa  243  9e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  30.46 
 
 
758 aa  242  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  3.74663e-06 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  27.16 
 
 
767 aa  241  3e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.03 
 
 
782 aa  240  6e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  32.58 
 
 
807 aa  240  8e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  30.16 
 
 
787 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  30.16 
 
 
787 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  29.04 
 
 
781 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  30.16 
 
 
787 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  24.57 
 
 
805 aa  239  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  26.58 
 
 
750 aa  237  5e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.86879e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  31.05 
 
 
778 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.75 
 
 
786 aa  236  1e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  26.61 
 
 
765 aa  236  2e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.94 
 
 
1088 aa  235  2e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.15 
 
 
778 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  27.65 
 
 
752 aa  229  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  25.23 
 
 
788 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  32.74 
 
 
789 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.93 
 
 
788 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>