127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0036 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  97.85 
 
 
790 aa  1608  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  45.17 
 
 
843 aa  649  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  45.36 
 
 
848 aa  668  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 
790 aa  1642  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  45.99 
 
 
825 aa  712  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  70.45 
 
 
795 aa  1166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  44.3 
 
 
858 aa  652  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  71.05 
 
 
795 aa  1169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  41.48 
 
 
780 aa  659  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  70.08 
 
 
795 aa  1157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  46.26 
 
 
834 aa  689  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  43.2 
 
 
807 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  40.36 
 
 
781 aa  616  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  43.06 
 
 
784 aa  615  1e-174  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  42.43 
 
 
810 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  42.16 
 
 
791 aa  595  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  43.33 
 
 
794 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  42.58 
 
 
824 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  43.01 
 
 
804 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  42.69 
 
 
791 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  42.01 
 
 
790 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  43.55 
 
 
789 aa  592  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  42.67 
 
 
787 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  41.67 
 
 
786 aa  588  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  42.67 
 
 
787 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  43.58 
 
 
784 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  42.67 
 
 
787 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  42.63 
 
 
786 aa  581  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  39.34 
 
 
780 aa  582  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  43.7 
 
 
786 aa  578  1e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  42.4 
 
 
800 aa  577  1e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  42.03 
 
 
767 aa  573  1e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  38.41 
 
 
778 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  5.28962e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  43.49 
 
 
787 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  41.61 
 
 
786 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  40.23 
 
 
781 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  38.7 
 
 
780 aa  528  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  37.95 
 
 
778 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  35.13 
 
 
789 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  38.12 
 
 
777 aa  495  1e-138  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  34.92 
 
 
788 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  36.78 
 
 
986 aa  436  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  35.25 
 
 
782 aa  417  1e-115  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  31.42 
 
 
780 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  31.48 
 
 
755 aa  366  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  28.66 
 
 
775 aa  355  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  31.61 
 
 
710 aa  349  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  30.03 
 
 
774 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 
759 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.03 
 
 
778 aa  341  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.39 
 
 
759 aa  340  8e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.64 
 
 
749 aa  339  1e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  29.69 
 
 
763 aa  337  5e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  28.87 
 
 
750 aa  337  6e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.86879e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  28.57 
 
 
768 aa  337  6e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  30.52 
 
 
769 aa  336  9e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  30.92 
 
 
748 aa  336  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  30.81 
 
 
752 aa  328  2e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  29.05 
 
 
789 aa  328  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  32.29 
 
 
720 aa  327  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  1.28676e-06 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  28.06 
 
 
765 aa  321  3e-86  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  28.71 
 
 
787 aa  321  4e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.26 
 
 
781 aa  320  4e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  30.46 
 
 
752 aa  317  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  29.57 
 
 
757 aa  315  2e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  30.83 
 
 
807 aa  315  2e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  30.44 
 
 
761 aa  314  5e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  27.26 
 
 
767 aa  313  8e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  29.92 
 
 
787 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.05 
 
 
965 aa  311  3e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.39 
 
 
762 aa  310  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  29.92 
 
 
761 aa  310  6e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  30.83 
 
 
760 aa  310  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  28.37 
 
 
758 aa  309  1e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  3.74663e-06 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
978 aa  308  2e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  30.33 
 
 
776 aa  306  8e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  28.9 
 
 
771 aa  306  1e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  34.77 
 
 
805 aa  305  2e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  28.68 
 
 
751 aa  303  6e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.56 
 
 
777 aa  299  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  29.66 
 
 
794 aa  298  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  27.63 
 
 
755 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  27.63 
 
 
755 aa  296  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  27.79 
 
 
755 aa  296  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  27.63 
 
 
755 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  27.63 
 
 
755 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  27.63 
 
 
755 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  27.63 
 
 
755 aa  295  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  27.25 
 
 
755 aa  289  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  27.68 
 
 
748 aa  285  2e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.42 
 
 
1050 aa  283  7e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  28.25 
 
 
753 aa  277  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.16 
 
 
1052 aa  265  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.26 
 
 
1053 aa  260  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.05 
 
 
1088 aa  253  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.09 
 
 
1051 aa  250  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.74 
 
 
1051 aa  250  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.82 
 
 
788 aa  249  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.53 
 
 
1053 aa  247  5e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  29.55 
 
 
807 aa  244  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.40305 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>