More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0030 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0030  acyl transferase domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  604  1e-172  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0031  acyl transferase domain-containing protein  96.09 
 
 
307 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3157  acyl transferase domain-containing protein  75.33 
 
 
307 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6851  acyl transferase domain-containing protein  75.41 
 
 
309 aa  405  1e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0052  acyl transferase domain protein  79.02 
 
 
307 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal  0.113572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0172  acyl transferase domain-containing protein  66.56 
 
 
308 aa  335  8e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3186  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  49.84 
 
 
312 aa  244  2e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2797  acyl transferase domain-containing protein  50 
 
 
312 aa  221  1e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0900005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1275  putative malonyl CoA-acylcarrier protein transacylase  46.89 
 
 
310 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0794  putative malonyl CoA-acylcarrier protein transacylase  46.89 
 
 
310 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1247  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  47.54 
 
 
310 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4418  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  47.21 
 
 
310 aa  201  2e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2044  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  46.56 
 
 
310 aa  197  1e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1165  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  46.23 
 
 
310 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.033586  normal  0.190387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1153  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  45.9 
 
 
310 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1590  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  49.67 
 
 
312 aa  184  1e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1488  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  49.67 
 
 
312 aa  184  1e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4292  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase-like protein  44.63 
 
 
304 aa  184  2e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1458  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.35 
 
 
312 aa  182  5e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.40194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0545  acyl transferase domain-containing protein  49.02 
 
 
312 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0608  acyl transferase domain-containing protein  49.02 
 
 
312 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0408113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3031  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  49.02 
 
 
312 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1262  acyl transferase domain-containing protein  49.02 
 
 
312 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1075  malonate decarboxylase, epsilon subunit  40.52 
 
 
306 aa  174  2e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1140  malonyl-CoA ACP transacylase  28.99 
 
 
306 aa  147  2e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.678313  normal  0.244808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4014  Acyl transferase region  37.85 
 
 
304 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2890  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  36.09 
 
 
303 aa  135  7e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.026871  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5368  (Acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  37.79 
 
 
302 aa  125  8e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1762  (acyl-carrier protein) S-malonyltransferase  36.45 
 
 
303 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0073  Acyl transferase  32.79 
 
 
307 aa  118  1e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10280  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.42 
 
 
309 aa  117  4e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0189442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0981  cyclic nucleotide-binding protein  35.05 
 
 
309 aa  114  2e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.102114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0916  cyclic nucleotide-binding protein  34.71 
 
 
309 aa  114  2e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1849  (Acyl-carrier protein) S-malonyltransferase  33.77 
 
 
307 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0600625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1051  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  34.83 
 
 
309 aa  111  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.418827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3818  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.74 
 
 
313 aa  109  7e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.79966e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1514  malonyl CoA-ACP transacylase  31.55 
 
 
319 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02909  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.35 
 
 
324 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2264  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  33.8 
 
 
309 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2182  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.87 
 
 
310 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491631  normal  0.0479122 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2791  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.87 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1981  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.67 
 
 
308 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  2.24477e-07  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0642  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.56 
 
 
310 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0221  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.33 
 
 
343 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2852  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.87 
 
 
310 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0331918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1769  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  31.96 
 
 
313 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1002  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.22 
 
 
310 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1122  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.56 
 
 
310 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2429  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  33.1 
 
 
311 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.952557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1600  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  30.69 
 
 
319 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0257295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2478  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.53 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0531  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  32.53 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2803  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.53 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1080  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.56 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.720629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2906  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  32.53 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360447  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1801  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.53 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4234  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  33.56 
 
 
310 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0166  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  27.39 
 
 
312 aa  102  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.264922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0130  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.33 
 
 
293 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0128  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.33 
 
 
293 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4573  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  30.42 
 
 
321 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124342  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002995  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.13 
 
 
307 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.98745e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0829  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.4 
 
 
310 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1608  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.52 
 
 
312 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.08664e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2632  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.89 
 
 
317 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2911  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.64 
 
 
311 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795839  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1718  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.53 
 
 
309 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1073  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  32.4 
 
 
311 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0406  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.14 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.669261  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4815  malonate decarboxylase, epsilon subunit  32.21 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0838464  normal  0.0174274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1731  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.39 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0998  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.22 
 
 
310 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0611  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.83 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  6.65754e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1905  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.77 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.64946e-10  hitchhiker  8.05799e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2041  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.21 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.68323e-07  normal  0.0169679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1390  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.96 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0740  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.6 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  6.9943e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3073  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.47 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1213  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.43 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.89491e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2504  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.3 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.92786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2240  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.97 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000615586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0432  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  31.03 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1184  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.31 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.165448 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2380  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.06 
 
 
423 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2002  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.57 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2877  malonate decarboxylase, epsilon subunit  32.65 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.825444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1602  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.18 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.63184e-08  hitchhiker  0.000801485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1345  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.02 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0491  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.68 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1577  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.45 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.74121e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2777  acyl carrier protein S-malonyltransferase  30.1 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1685  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.45 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.98339e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2294  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.48 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.22204e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3469  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.19 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122116  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0637  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  30.29 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.115322 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3500  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.45 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.88283e-09  decreased coverage  0.00257389 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1590  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  27.54 
 
 
315 aa  94  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1644  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.64 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1349  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.32 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1088  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.93 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>